Protein–RNA interactions for Protein: Q15751

HERC1, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC1, humanhuman

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Length 4,861 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC1Q15751 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
HERC1Q15751 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
HERC1Q15751 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
HERC1Q15751 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
HERC1Q15751 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
HERC1Q15751 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
HERC1Q15751 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
HERC1Q15751 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
HERC1Q15751 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
HERC1Q15751 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
HERC1Q15751 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
HERC1Q15751 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
HERC1Q15751 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
HERC1Q15751 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.36□□□□□ -0.43
HERC1Q15751 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
HERC1Q15751 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
HERC1Q15751 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
HERC1Q15751 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
HERC1Q15751 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
HERC1Q15751 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
HERC1Q15751 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
HERC1Q15751 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
HERC1Q15751 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
HERC1Q15751 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
HERC1Q15751 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
HERC1Q15751 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
HERC1Q15751 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
HERC1Q15751 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
HERC1Q15751 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
HERC1Q15751 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
HERC1Q15751 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
HERC1Q15751 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
HERC1Q15751 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
HERC1Q15751 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
HERC1Q15751 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
HERC1Q15751 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
HERC1Q15751 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
HERC1Q15751 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
HERC1Q15751 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
HERC1Q15751 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
HERC1Q15751 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
HERC1Q15751 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
HERC1Q15751 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
HERC1Q15751 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
HERC1Q15751 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC12.34□□□□□ -0.43
HERC1Q15751 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
HERC1Q15751 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
HERC1Q15751 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
HERC1Q15751 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
HERC1Q15751 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
HERC1Q15751 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
HERC1Q15751 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
HERC1Q15751 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
HERC1Q15751 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
HERC1Q15751 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
HERC1Q15751 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
HERC1Q15751 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
HERC1Q15751 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC12.34□□□□□ -0.43
HERC1Q15751 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
HERC1Q15751 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
HERC1Q15751 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
HERC1Q15751 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
HERC1Q15751 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC12.33□□□□□ -0.43
HERC1Q15751 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
HERC1Q15751 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
HERC1Q15751 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
HERC1Q15751 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
HERC1Q15751 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
HERC1Q15751 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
HERC1Q15751 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
HERC1Q15751 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
HERC1Q15751 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
HERC1Q15751 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
HERC1Q15751 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
HERC1Q15751 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
HERC1Q15751 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
HERC1Q15751 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
HERC1Q15751 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
HERC1Q15751 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC12.33□□□□□ -0.44
HERC1Q15751 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
HERC1Q15751 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
HERC1Q15751 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
HERC1Q15751 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
HERC1Q15751 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
HERC1Q15751 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
HERC1Q15751 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC12.32□□□□□ -0.44
HERC1Q15751 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
HERC1Q15751 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
HERC1Q15751 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
HERC1Q15751 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
HERC1Q15751 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
HERC1Q15751 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
HERC1Q15751 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
HERC1Q15751 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
HERC1Q15751 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
HERC1Q15751 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
HERC1Q15751 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
HERC1Q15751 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
HERC1Q15751 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
HERC1Q15751 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
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