Protein–RNA interactions for Protein: Q15459

SF3A1, Splicing factor 3A subunit 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 793 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3A1Q15459 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SF3A1Q15459 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SF3A1Q15459 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SF3A1Q15459 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SF3A1Q15459 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SF3A1Q15459 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SF3A1Q15459 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SF3A1Q15459 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SF3A1Q15459 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SF3A1Q15459 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SF3A1Q15459 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SF3A1Q15459 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SF3A1Q15459 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SF3A1Q15459 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SF3A1Q15459 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SF3A1Q15459 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SF3A1Q15459 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SF3A1Q15459 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SF3A1Q15459 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SF3A1Q15459 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SF3A1Q15459 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SF3A1Q15459 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SF3A1Q15459 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SF3A1Q15459 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SF3A1Q15459 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SF3A1Q15459 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SF3A1Q15459 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SF3A1Q15459 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
SF3A1Q15459 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SF3A1Q15459 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SF3A1Q15459 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SF3A1Q15459 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SF3A1Q15459 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SF3A1Q15459 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SF3A1Q15459 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SF3A1Q15459 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
SF3A1Q15459 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SF3A1Q15459 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SF3A1Q15459 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SF3A1Q15459 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SF3A1Q15459 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SF3A1Q15459 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SF3A1Q15459 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SF3A1Q15459 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SF3A1Q15459 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SF3A1Q15459 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SF3A1Q15459 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SF3A1Q15459 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SF3A1Q15459 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SF3A1Q15459 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SF3A1Q15459 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SF3A1Q15459 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SF3A1Q15459 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SF3A1Q15459 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SF3A1Q15459 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SF3A1Q15459 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SF3A1Q15459 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SF3A1Q15459 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SF3A1Q15459 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SF3A1Q15459 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SF3A1Q15459 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SF3A1Q15459 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SF3A1Q15459 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SF3A1Q15459 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SF3A1Q15459 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SF3A1Q15459 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SF3A1Q15459 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SF3A1Q15459 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SF3A1Q15459 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SF3A1Q15459 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SF3A1Q15459 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SF3A1Q15459 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SF3A1Q15459 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
SF3A1Q15459 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SF3A1Q15459 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SF3A1Q15459 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SF3A1Q15459 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SF3A1Q15459 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SF3A1Q15459 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SF3A1Q15459 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SF3A1Q15459 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SF3A1Q15459 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SF3A1Q15459 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SF3A1Q15459 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
SF3A1Q15459 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SF3A1Q15459 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SF3A1Q15459 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SF3A1Q15459 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
SF3A1Q15459 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.44
SF3A1Q15459 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
SF3A1Q15459 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
SF3A1Q15459 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
SF3A1Q15459 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SF3A1Q15459 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SF3A1Q15459 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SF3A1Q15459 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SF3A1Q15459 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SF3A1Q15459 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SF3A1Q15459 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SF3A1Q15459 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
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