Protein–RNA interactions for Protein: Q15431

SYCP1, Synaptonemal complex protein 1, humanhuman

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Length 976 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP1Q15431 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SYCP1Q15431 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SYCP1Q15431 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SYCP1Q15431 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SYCP1Q15431 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SYCP1Q15431 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
SYCP1Q15431 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
SYCP1Q15431 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SYCP1Q15431 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SYCP1Q15431 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SYCP1Q15431 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SYCP1Q15431 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SYCP1Q15431 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SYCP1Q15431 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SYCP1Q15431 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SYCP1Q15431 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SYCP1Q15431 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SYCP1Q15431 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SYCP1Q15431 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SYCP1Q15431 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SYCP1Q15431 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SYCP1Q15431 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SYCP1Q15431 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SYCP1Q15431 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SYCP1Q15431 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SYCP1Q15431 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SYCP1Q15431 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SYCP1Q15431 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SYCP1Q15431 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SYCP1Q15431 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
SYCP1Q15431 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SYCP1Q15431 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SYCP1Q15431 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SYCP1Q15431 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SYCP1Q15431 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SYCP1Q15431 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SYCP1Q15431 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SYCP1Q15431 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
SYCP1Q15431 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SYCP1Q15431 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SYCP1Q15431 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SYCP1Q15431 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SYCP1Q15431 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SYCP1Q15431 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SYCP1Q15431 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SYCP1Q15431 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SYCP1Q15431 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SYCP1Q15431 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SYCP1Q15431 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SYCP1Q15431 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SYCP1Q15431 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SYCP1Q15431 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SYCP1Q15431 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SYCP1Q15431 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SYCP1Q15431 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SYCP1Q15431 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SYCP1Q15431 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SYCP1Q15431 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SYCP1Q15431 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SYCP1Q15431 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SYCP1Q15431 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SYCP1Q15431 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SYCP1Q15431 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SYCP1Q15431 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SYCP1Q15431 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SYCP1Q15431 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SYCP1Q15431 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SYCP1Q15431 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SYCP1Q15431 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SYCP1Q15431 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SYCP1Q15431 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SYCP1Q15431 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SYCP1Q15431 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SYCP1Q15431 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SYCP1Q15431 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SYCP1Q15431 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SYCP1Q15431 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SYCP1Q15431 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SYCP1Q15431 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SYCP1Q15431 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SYCP1Q15431 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SYCP1Q15431 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SYCP1Q15431 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SYCP1Q15431 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SYCP1Q15431 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SYCP1Q15431 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SYCP1Q15431 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SYCP1Q15431 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SYCP1Q15431 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SYCP1Q15431 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SYCP1Q15431 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SYCP1Q15431 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SYCP1Q15431 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SYCP1Q15431 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SYCP1Q15431 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SYCP1Q15431 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SYCP1Q15431 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SYCP1Q15431 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SYCP1Q15431 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SYCP1Q15431 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
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