Protein–RNA interactions for Protein: Q15011

HERPUD1, Homocysteine-responsive endoplasmic reticulum-resident ubiquitin-like domain member 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERPUD1Q15011 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
HERPUD1Q15011 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.56■□□□□ 0.4
HERPUD1Q15011 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
HERPUD1Q15011 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
HERPUD1Q15011 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
HERPUD1Q15011 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
HERPUD1Q15011 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
HERPUD1Q15011 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
HERPUD1Q15011 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
HERPUD1Q15011 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
HERPUD1Q15011 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
HERPUD1Q15011 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC17.56■□□□□ 0.4
HERPUD1Q15011 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
HERPUD1Q15011 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
HERPUD1Q15011 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
HERPUD1Q15011 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
HERPUD1Q15011 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
HERPUD1Q15011 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
HERPUD1Q15011 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
HERPUD1Q15011 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
HERPUD1Q15011 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
HERPUD1Q15011 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
HERPUD1Q15011 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
HERPUD1Q15011 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
HERPUD1Q15011 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
HERPUD1Q15011 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
HERPUD1Q15011 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
HERPUD1Q15011 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
HERPUD1Q15011 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
HERPUD1Q15011 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
HERPUD1Q15011 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
HERPUD1Q15011 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
HERPUD1Q15011 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
HERPUD1Q15011 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
HERPUD1Q15011 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
HERPUD1Q15011 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
HERPUD1Q15011 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
HERPUD1Q15011 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
HERPUD1Q15011 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
HERPUD1Q15011 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
HERPUD1Q15011 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
HERPUD1Q15011 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
HERPUD1Q15011 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
HERPUD1Q15011 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
HERPUD1Q15011 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
HERPUD1Q15011 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
HERPUD1Q15011 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
HERPUD1Q15011 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
HERPUD1Q15011 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
HERPUD1Q15011 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
HERPUD1Q15011 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
HERPUD1Q15011 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
HERPUD1Q15011 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
HERPUD1Q15011 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
HERPUD1Q15011 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HERPUD1Q15011 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
HERPUD1Q15011 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
HERPUD1Q15011 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
HERPUD1Q15011 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HERPUD1Q15011 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HERPUD1Q15011 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
HERPUD1Q15011 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HERPUD1Q15011 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HERPUD1Q15011 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HERPUD1Q15011 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
HERPUD1Q15011 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC17.53■□□□□ 0.4
HERPUD1Q15011 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
HERPUD1Q15011 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
HERPUD1Q15011 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HERPUD1Q15011 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HERPUD1Q15011 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HERPUD1Q15011 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
HERPUD1Q15011 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HERPUD1Q15011 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
HERPUD1Q15011 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HERPUD1Q15011 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HERPUD1Q15011 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HERPUD1Q15011 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
HERPUD1Q15011 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
HERPUD1Q15011 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
HERPUD1Q15011 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
HERPUD1Q15011 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
HERPUD1Q15011 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
HERPUD1Q15011 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
HERPUD1Q15011 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
HERPUD1Q15011 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
HERPUD1Q15011 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
HERPUD1Q15011 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
HERPUD1Q15011 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
HERPUD1Q15011 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
HERPUD1Q15011 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
HERPUD1Q15011 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
HERPUD1Q15011 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
HERPUD1Q15011 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
HERPUD1Q15011 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
HERPUD1Q15011 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
HERPUD1Q15011 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
HERPUD1Q15011 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
HERPUD1Q15011 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
HERPUD1Q15011 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms