Protein–RNA interactions for Protein: Q03181

PPARD, Peroxisome proliferator-activated receptor delta, humanhuman

Predictions only

Length 441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPARDQ03181 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PPARDQ03181 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PPARDQ03181 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PPARDQ03181 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PPARDQ03181 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PPARDQ03181 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PPARDQ03181 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PPARDQ03181 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PPARDQ03181 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PPARDQ03181 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PPARDQ03181 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PPARDQ03181 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PPARDQ03181 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PPARDQ03181 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PPARDQ03181 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PPARDQ03181 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PPARDQ03181 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PPARDQ03181 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PPARDQ03181 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PPARDQ03181 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PPARDQ03181 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PPARDQ03181 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PPARDQ03181 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PPARDQ03181 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PPARDQ03181 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PPARDQ03181 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PPARDQ03181 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PPARDQ03181 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PPARDQ03181 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PPARDQ03181 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PPARDQ03181 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PPARDQ03181 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PPARDQ03181 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
PPARDQ03181 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PPARDQ03181 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PPARDQ03181 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PPARDQ03181 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PPARDQ03181 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PPARDQ03181 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PPARDQ03181 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PPARDQ03181 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PPARDQ03181 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PPARDQ03181 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PPARDQ03181 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PPARDQ03181 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PPARDQ03181 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PPARDQ03181 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PPARDQ03181 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PPARDQ03181 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PPARDQ03181 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PPARDQ03181 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PPARDQ03181 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PPARDQ03181 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PPARDQ03181 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PPARDQ03181 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PPARDQ03181 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PPARDQ03181 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
PPARDQ03181 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PPARDQ03181 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PPARDQ03181 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PPARDQ03181 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PPARDQ03181 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PPARDQ03181 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PPARDQ03181 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PPARDQ03181 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PPARDQ03181 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PPARDQ03181 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PPARDQ03181 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PPARDQ03181 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PPARDQ03181 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PPARDQ03181 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PPARDQ03181 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PPARDQ03181 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PPARDQ03181 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PPARDQ03181 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
PPARDQ03181 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
PPARDQ03181 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
PPARDQ03181 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PPARDQ03181 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PPARDQ03181 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PPARDQ03181 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PPARDQ03181 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PPARDQ03181 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PPARDQ03181 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PPARDQ03181 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PPARDQ03181 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PPARDQ03181 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
PPARDQ03181 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PPARDQ03181 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PPARDQ03181 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PPARDQ03181 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PPARDQ03181 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PPARDQ03181 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PPARDQ03181 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
PPARDQ03181 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PPARDQ03181 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PPARDQ03181 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PPARDQ03181 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PPARDQ03181 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PPARDQ03181 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms