Protein–RNA interactions for Protein: P48995

TRPC1, Short transient receptor potential channel 1, humanhuman

Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPC1P48995 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRPC1P48995 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRPC1P48995 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TRPC1P48995 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TRPC1P48995 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TRPC1P48995 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TRPC1P48995 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TRPC1P48995 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TRPC1P48995 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TRPC1P48995 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TRPC1P48995 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TRPC1P48995 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TRPC1P48995 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TRPC1P48995 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TRPC1P48995 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TRPC1P48995 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TRPC1P48995 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TRPC1P48995 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
TRPC1P48995 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
TRPC1P48995 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
TRPC1P48995 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
TRPC1P48995 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
TRPC1P48995 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
TRPC1P48995 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
TRPC1P48995 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.8
TRPC1P48995 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
TRPC1P48995 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
TRPC1P48995 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRPC1P48995 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRPC1P48995 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRPC1P48995 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRPC1P48995 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRPC1P48995 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRPC1P48995 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRPC1P48995 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRPC1P48995 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRPC1P48995 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRPC1P48995 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRPC1P48995 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRPC1P48995 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRPC1P48995 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRPC1P48995 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRPC1P48995 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRPC1P48995 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRPC1P48995 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRPC1P48995 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRPC1P48995 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRPC1P48995 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRPC1P48995 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRPC1P48995 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRPC1P48995 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TRPC1P48995 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TRPC1P48995 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TRPC1P48995 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TRPC1P48995 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TRPC1P48995 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TRPC1P48995 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TRPC1P48995 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TRPC1P48995 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
TRPC1P48995 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TRPC1P48995 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TRPC1P48995 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TRPC1P48995 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TRPC1P48995 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TRPC1P48995 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TRPC1P48995 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TRPC1P48995 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TRPC1P48995 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TRPC1P48995 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
TRPC1P48995 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TRPC1P48995 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TRPC1P48995 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TRPC1P48995 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TRPC1P48995 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TRPC1P48995 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TRPC1P48995 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TRPC1P48995 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TRPC1P48995 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TRPC1P48995 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TRPC1P48995 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TRPC1P48995 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
TRPC1P48995 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TRPC1P48995 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TRPC1P48995 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TRPC1P48995 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TRPC1P48995 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
TRPC1P48995 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TRPC1P48995 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TRPC1P48995 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TRPC1P48995 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TRPC1P48995 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TRPC1P48995 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TRPC1P48995 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TRPC1P48995 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TRPC1P48995 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TRPC1P48995 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TRPC1P48995 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TRPC1P48995 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TRPC1P48995 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TRPC1P48995 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms