Protein–RNA interactions for Protein: P35638

DDIT3, DNA damage-inducible transcript 3 protein, humanhuman

Predictions only

Length 169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDIT3P35638 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
DDIT3P35638 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
DDIT3P35638 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
DDIT3P35638 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
DDIT3P35638 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
DDIT3P35638 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
DDIT3P35638 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
DDIT3P35638 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
DDIT3P35638 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
DDIT3P35638 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
DDIT3P35638 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
DDIT3P35638 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
DDIT3P35638 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
DDIT3P35638 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
DDIT3P35638 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
DDIT3P35638 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
DDIT3P35638 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
DDIT3P35638 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
DDIT3P35638 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
DDIT3P35638 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
DDIT3P35638 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
DDIT3P35638 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
DDIT3P35638 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
DDIT3P35638 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
DDIT3P35638 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
DDIT3P35638 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
DDIT3P35638 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
DDIT3P35638 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
DDIT3P35638 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC24.66■■□□□ 1.54
DDIT3P35638 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
DDIT3P35638 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
DDIT3P35638 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
DDIT3P35638 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
DDIT3P35638 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
DDIT3P35638 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
DDIT3P35638 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
DDIT3P35638 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
DDIT3P35638 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
DDIT3P35638 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
DDIT3P35638 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
DDIT3P35638 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
DDIT3P35638 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
DDIT3P35638 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
DDIT3P35638 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
DDIT3P35638 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
DDIT3P35638 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
DDIT3P35638 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
DDIT3P35638 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
DDIT3P35638 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
DDIT3P35638 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
DDIT3P35638 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
DDIT3P35638 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
DDIT3P35638 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
DDIT3P35638 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
DDIT3P35638 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
DDIT3P35638 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
DDIT3P35638 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
DDIT3P35638 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
DDIT3P35638 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
DDIT3P35638 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
DDIT3P35638 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
DDIT3P35638 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
DDIT3P35638 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
DDIT3P35638 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
DDIT3P35638 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
DDIT3P35638 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
DDIT3P35638 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
DDIT3P35638 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
DDIT3P35638 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
DDIT3P35638 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
DDIT3P35638 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
DDIT3P35638 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
DDIT3P35638 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
DDIT3P35638 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
DDIT3P35638 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
DDIT3P35638 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
DDIT3P35638 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
DDIT3P35638 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
DDIT3P35638 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
DDIT3P35638 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
DDIT3P35638 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
DDIT3P35638 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
DDIT3P35638 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
DDIT3P35638 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
DDIT3P35638 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
DDIT3P35638 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
DDIT3P35638 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
DDIT3P35638 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
DDIT3P35638 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
DDIT3P35638 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
DDIT3P35638 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
DDIT3P35638 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
DDIT3P35638 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
DDIT3P35638 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
DDIT3P35638 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
DDIT3P35638 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
DDIT3P35638 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
DDIT3P35638 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
DDIT3P35638 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
DDIT3P35638 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms