Protein–RNA interactions for Protein: O75379

VAMP4, Vesicle-associated membrane protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP4O75379 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
VAMP4O75379 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
VAMP4O75379 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
VAMP4O75379 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
VAMP4O75379 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
VAMP4O75379 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
VAMP4O75379 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
VAMP4O75379 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
VAMP4O75379 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
VAMP4O75379 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
VAMP4O75379 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC26.95■■□□□ 1.9
VAMP4O75379 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
VAMP4O75379 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
VAMP4O75379 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
VAMP4O75379 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
VAMP4O75379 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
VAMP4O75379 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
VAMP4O75379 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
VAMP4O75379 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
VAMP4O75379 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
VAMP4O75379 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC26.94■■□□□ 1.9
VAMP4O75379 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
VAMP4O75379 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
VAMP4O75379 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC26.94■■□□□ 1.9
VAMP4O75379 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
VAMP4O75379 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
VAMP4O75379 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
VAMP4O75379 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
VAMP4O75379 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
VAMP4O75379 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
VAMP4O75379 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
VAMP4O75379 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
VAMP4O75379 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
VAMP4O75379 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
VAMP4O75379 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
VAMP4O75379 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC26.93■■□□□ 1.9
VAMP4O75379 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
VAMP4O75379 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
VAMP4O75379 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
VAMP4O75379 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
VAMP4O75379 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
VAMP4O75379 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
VAMP4O75379 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
VAMP4O75379 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
VAMP4O75379 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
VAMP4O75379 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
VAMP4O75379 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
VAMP4O75379 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
VAMP4O75379 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
VAMP4O75379 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
VAMP4O75379 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
VAMP4O75379 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
VAMP4O75379 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
VAMP4O75379 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC26.92■■□□□ 1.9
VAMP4O75379 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
VAMP4O75379 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
VAMP4O75379 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
VAMP4O75379 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
VAMP4O75379 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
VAMP4O75379 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
VAMP4O75379 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
VAMP4O75379 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
VAMP4O75379 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
VAMP4O75379 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
VAMP4O75379 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC26.91■■□□□ 1.9
VAMP4O75379 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
VAMP4O75379 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC26.91■■□□□ 1.9
VAMP4O75379 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
VAMP4O75379 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
VAMP4O75379 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
VAMP4O75379 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
VAMP4O75379 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
VAMP4O75379 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
VAMP4O75379 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
VAMP4O75379 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
VAMP4O75379 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
VAMP4O75379 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
VAMP4O75379 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
VAMP4O75379 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
VAMP4O75379 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
VAMP4O75379 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
VAMP4O75379 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
VAMP4O75379 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC26.9■■□□□ 1.9
VAMP4O75379 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC26.89■■□□□ 1.9
VAMP4O75379 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
VAMP4O75379 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
VAMP4O75379 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
VAMP4O75379 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
VAMP4O75379 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
VAMP4O75379 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
VAMP4O75379 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
VAMP4O75379 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
VAMP4O75379 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
VAMP4O75379 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
VAMP4O75379 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
VAMP4O75379 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
VAMP4O75379 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
VAMP4O75379 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
VAMP4O75379 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
VAMP4O75379 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms