Protein–RNA interactions for Protein: O00571

DDX3X, ATP-dependent RNA helicase DDX3X, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 662 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX3XO00571 CCDC90B-207ENST00000526631 628 ntTSL 28.21□□□□□ -1.12e-15■■■■■ 36.8
DDX3XO00571 CCDC90B-212ENST00000529312 773 ntTSL 57.9□□□□□ -1.142e-15■■■■■ 36.8
DDX3XO00571 LLGL1-201ENST00000316843 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.083e-8■■■■■ 36.8
DDX3XO00571 LLGL1-203ENST00000621229 3187 ntTSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.13e-8■■■■■ 36.8
DDX3XO00571 RAD50-209ENST00000533482 4373 ntTSL 1 (best)13.15□□□□□ -0.35e-15■■■■■ 36.8
DDX3XO00571 AC116366.3-201ENST00000638452 7893 ntAPPRIS ALT2 TSL 512.07□□□□□ -0.485e-15■■■■■ 36.8
DDX3XO00571 RAD50-201ENST00000378823 8306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.65e-15■■■■■ 36.8
DDX3XO00571 AC116366.3-203ENST00000639899 8173 ntTSL 58.38□□□□□ -1.075e-15■■■■■ 36.8
DDX3XO00571 AC116366.3-205ENST00000640655 8032 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.215e-15■■■■■ 36.8
DDX3XO00571 RAD50-202ENST00000416135 923 ntTSL 1 (best)7.19□□□□□ -1.265e-15■■■■■ 36.8
DDX3XO00571 AC116366.3-204ENST00000638504 7262 ntAPPRIS P5 TSL 57.15□□□□□ -1.265e-15■■■■■ 36.8
DDX3XO00571 AC116366.3-202ENST00000638568 7956 ntAPPRIS ALT2 TSL 56.73□□□□□ -1.335e-15■■■■■ 36.8
DDX3XO00571 KDM2B-216ENST00000543025 2522 ntTSL 1 (best)18.06■□□□□ 0.482e-11■■■■■ 36.7
DDX3XO00571 KDM2B-207ENST00000538243 4110 ntTSL 217.41■□□□□ 0.382e-11■■■■■ 36.7
DDX3XO00571 KDM2B-205ENST00000536437 2762 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.152e-11■■■■■ 36.7
DDX3XO00571 KDM2B-201ENST00000377069 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.022e-11■■■■■ 36.7
DDX3XO00571 KDM2B-202ENST00000377071 4595 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.022e-11■■■■■ 36.7
DDX3XO00571 KDM2B-215ENST00000542973 3170 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.072e-11■■■■■ 36.7
DDX3XO00571 KDM2B-219ENST00000611216 3434 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.142e-11■■■■■ 36.7
DDX3XO00571 KDM2B-209ENST00000538503 6676 ntTSL 513.28□□□□□ -0.282e-11■■■■■ 36.7
DDX3XO00571 SLC38A10-204ENST00000539748 528 ntTSL 314.2□□□□□ -0.144e-7■■■■■ 36.7
DDX3XO00571 PLEC-204ENST00000354958 14751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.624e-6■■■■■ 36.7
DDX3XO00571 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.682e-6■■■■■ 36.7
DDX3XO00571 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.981e-9■■■■■ 36.7
DDX3XO00571 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.033e-9■■■■■ 36.7
DDX3XO00571 MTFP1-204ENST00000412752 759 ntTSL 321.2■□□□□ 0.983e-9■■■■■ 36.7
DDX3XO00571 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.843e-9■■■■■ 36.7
DDX3XO00571 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.813e-9■■■■■ 36.7
DDX3XO00571 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.83e-9■■■■■ 36.7
DDX3XO00571 MTFP1-205ENST00000614920 648 ntTSL 219.18■□□□□ 0.663e-9■■■■■ 36.7
DDX3XO00571 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.653e-9■■■■■ 36.7
DDX3XO00571 AC004832.3-201ENST00000454552 872 ntTSL 214.38□□□□□ -0.113e-9■■■■■ 36.7
DDX3XO00571 AC004832.3-203ENST00000439023 694 ntTSL 514.38□□□□□ -0.113e-9■■■■■ 36.7
DDX3XO00571 GALNT1-206ENST00000591924 542 ntTSL 322.05■■□□□ 1.126e-8■■■■■ 36.7
DDX3XO00571 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.92e-32■■■■■ 36.7
DDX3XO00571 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.654e-8■■■■■ 36.7
DDX3XO00571 FIS1-206ENST00000473527 1005 ntTSL 1 (best)19.14■□□□□ 0.654e-8■■■■■ 36.7
DDX3XO00571 BCAP31-202ENST00000416815 688 ntTSL 519.08■□□□□ 0.642e-32■■■■■ 36.7
DDX3XO00571 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.374e-8■■■■■ 36.7
DDX3XO00571 FIS1-204ENST00000449367 745 ntTSL 217.03■□□□□ 0.324e-8■■■■■ 36.7
DDX3XO00571 FIS1-201ENST00000223136 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.114e-8■■■■■ 36.7
DDX3XO00571 FIS1-202ENST00000435848 692 ntTSL 515.33■□□□□ 0.044e-8■■■■■ 36.7
DDX3XO00571 BCAP31-203ENST00000423827 669 ntTSL 514.49□□□□□ -0.092e-32■■■■■ 36.7
DDX3XO00571 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC29.73■■■□□ 2.357e-22■■■■■ 36.6
DDX3XO00571 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.364e-55■■■■■ 36.6
DDX3XO00571 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.24e-55■■■■■ 36.6
DDX3XO00571 STON2-208ENST00000557055 603 ntTSL 516.59■□□□□ 0.255e-7■■■■■ 36.6
DDX3XO00571 TTC3-223ENST00000492275 769 ntTSL 326.82■■□□□ 1.888e-8■■■■■ 36.6
DDX3XO00571 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.838e-8■■■■■ 36.6
DDX3XO00571 TTC3-210ENST00000450533 2451 ntTSL 1 (best)24.19■■□□□ 1.468e-8■■■■■ 36.6
DDX3XO00571 TTC3-212ENST00000463216 842 ntTSL 524.17■■□□□ 1.468e-8■■■■■ 36.6
DDX3XO00571 TTC3-224ENST00000494243 861 ntTSL 524■■□□□ 1.438e-8■■■■■ 36.6
DDX3XO00571 TTC3-217ENST00000481605 1540 ntTSL 523.76■■□□□ 1.398e-8■■■■■ 36.6
DDX3XO00571 TTC3-209ENST00000438055 3606 ntTSL 518.2■□□□□ 0.58e-8■■■■■ 36.6
DDX3XO00571 TTC3-207ENST00000418766 3771 ntTSL 517.62■□□□□ 0.418e-8■■■■■ 36.6
DDX3XO00571 TTC3-219ENST00000485402 3626 ntTSL 516■□□□□ 0.158e-8■■■■■ 36.6
DDX3XO00571 TTC3-202ENST00000355666 7712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.728e-8■■■■■ 36.6
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DDX3XO00571 ZNF496-204ENST00000477903 907 ntTSL 321.67■■□□□ 1.067e-11■■■■■ 36.6
DDX3XO00571 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.267e-11■■■■■ 36.6
DDX3XO00571 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.634e-7■■■■■ 36.6
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DDX3XO00571 LMBR1L-205ENST00000547670 1866 ntTSL 1 (best)18.54■□□□□ 0.564e-7■■■■■ 36.6
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DDX3XO00571 LMBR1L-217ENST00000551115 965 ntTSL 1 (best)17.6■□□□□ 0.414e-7■■■■■ 36.6
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DDX3XO00571 LMBR1L-203ENST00000457164 1081 ntTSL 217.6■□□□□ 0.414e-7■■■■■ 36.6
DDX3XO00571 LMBR1L-206ENST00000547675 581 ntTSL 517.6■□□□□ 0.414e-7■■■■■ 36.6
DDX3XO00571 LMBR1L-202ENST00000417750 2334 ntTSL 217.5■□□□□ 0.394e-7■■■■■ 36.6
DDX3XO00571 LMBR1L-225ENST00000552153 549 ntTSL 416.5■□□□□ 0.234e-7■■■■■ 36.6
DDX3XO00571 LMBR1L-216ENST00000550867 2800 ntTSL 1 (best)15.19■□□□□ 0.024e-7■■■■■ 36.6
DDX3XO00571 LMBR1L-201ENST00000267102 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.124e-7■■■■■ 36.6
DDX3XO00571 LMBR1L-221ENST00000551535 874 ntTSL 214.14□□□□□ -0.154e-7■■■■■ 36.6
DDX3XO00571 LMBR1L-230ENST00000553204 582 ntTSL 313.18□□□□□ -0.34e-7■■■■■ 36.6
DDX3XO00571 LMBR1L-222ENST00000551782 567 ntTSL 48.99□□□□□ -0.974e-7■■■■■ 36.6
DDX3XO00571 LMBR1L-215ENST00000550815 541 ntTSL 45.21□□□□□ -1.584e-7■■■■■ 36.6
DDX3XO00571 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.039e-7■■■■■ 36.6
DDX3XO00571 AQP11-202ENST00000528638 1202 ntTSL 1 (best)18.76■□□□□ 0.599e-7■■■■■ 36.6
DDX3XO00571 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.643e-7■■■■■ 36.6
DDX3XO00571 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC18.93■□□□□ 0.623e-7■■■■■ 36.6
DDX3XO00571 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.53e-7■■■■■ 36.6
DDX3XO00571 ELAC2-201ENST00000338034 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.133e-7■■■■■ 36.6
DDX3XO00571 ELAC2-217ENST00000583371 479 ntTSL 46.34□□□□□ -1.393e-7■■■■■ 36.6
DDX3XO00571 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.842e-8■■■■■ 36.6
DDX3XO00571 CHMP7-205ENST00000519503 917 ntTSL 221.89■■□□□ 1.097e-12■■■■■ 36.5
DDX3XO00571 CHMP7-207ENST00000519984 666 ntTSL 321.65■■□□□ 1.067e-12■■■■■ 36.5
DDX3XO00571 CHMP7-206ENST00000519529 690 ntTSL 320.34■□□□□ 0.857e-12■■■■■ 36.5
DDX3XO00571 CHMP7-204ENST00000519414 914 ntTSL 319.29■□□□□ 0.687e-12■■■■■ 36.5
DDX3XO00571 CHMP7-203ENST00000517325 2639 ntTSL 218.19■□□□□ 0.57e-12■■■■■ 36.5
DDX3XO00571 CHMP7-202ENST00000397677 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.037e-12■■■■■ 36.5
DDX3XO00571 CHMP7-201ENST00000313219 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.057e-12■■■■■ 36.5
DDX3XO00571 ZCCHC10-205ENST00000508080 712 ntTSL 37.61□□□□□ -1.192e-7■■■■■ 36.5
DDX3XO00571 ZCCHC10-210ENST00000513848 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.08□□□□□ -1.282e-7■■■■■ 36.5
DDX3XO00571 ZCCHC10-209ENST00000513541 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.92□□□□□ -1.32e-7■■■■■ 36.5
DDX3XO00571 ZCCHC10-208ENST00000511440 548 ntTSL 46.61□□□□□ -1.352e-7■■■■■ 36.5
DDX3XO00571 ZCCHC10-204ENST00000506403 608 ntTSL 56.61□□□□□ -1.352e-7■■■■■ 36.5
DDX3XO00571 ZCCHC10-207ENST00000509437 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.372e-7■■■■■ 36.5
DDX3XO00571 ZCCHC10-203ENST00000504170 325 ntTSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.452e-7■■■■■ 36.5
DDX3XO00571 ZCCHC10-206ENST00000509008 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.06□□□□□ -1.762e-7■■■■■ 36.5
DDX3XO00571 ZCCHC10-201ENST00000324170 2178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.852e-7■■■■■ 36.5
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