Protein–RNA interactions for Protein: V9GYY5

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
V9GYY5 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
V9GYY5 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
V9GYY5 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
V9GYY5 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
V9GYY5 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
V9GYY5 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
V9GYY5 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
V9GYY5 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
V9GYY5 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
V9GYY5 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
V9GYY5 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
V9GYY5 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
V9GYY5 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
V9GYY5 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
V9GYY5 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
V9GYY5 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
V9GYY5 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
V9GYY5 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
V9GYY5 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
V9GYY5 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
V9GYY5 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
V9GYY5 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
V9GYY5 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
V9GYY5 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
V9GYY5 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
V9GYY5 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
V9GYY5 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
V9GYY5 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
V9GYY5 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
V9GYY5 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
V9GYY5 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
V9GYY5 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
V9GYY5 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
V9GYY5 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
V9GYY5 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
V9GYY5 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
V9GYY5 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
V9GYY5 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
V9GYY5 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
V9GYY5 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
V9GYY5 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
V9GYY5 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
V9GYY5 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
V9GYY5 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
V9GYY5 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
V9GYY5 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
V9GYY5 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
V9GYY5 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
V9GYY5 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
V9GYY5 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
V9GYY5 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
V9GYY5 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
V9GYY5 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
V9GYY5 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
V9GYY5 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
V9GYY5 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
V9GYY5 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
V9GYY5 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
V9GYY5 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
V9GYY5 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
V9GYY5 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
V9GYY5 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
V9GYY5 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
V9GYY5 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
V9GYY5 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
V9GYY5 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
V9GYY5 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
V9GYY5 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
V9GYY5 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
V9GYY5 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
V9GYY5 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
V9GYY5 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
V9GYY5 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
V9GYY5 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
V9GYY5 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
V9GYY5 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
V9GYY5 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
V9GYY5 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
V9GYY5 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
V9GYY5 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
V9GYY5 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
V9GYY5 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
V9GYY5 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
V9GYY5 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
V9GYY5 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
V9GYY5 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
V9GYY5 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
V9GYY5 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
V9GYY5 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
V9GYY5 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
V9GYY5 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
V9GYY5 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
V9GYY5 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
V9GYY5 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC28.12■■■□□ 2.09
V9GYY5 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
V9GYY5 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
V9GYY5 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
V9GYY5 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
V9GYY5 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
V9GYY5 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.5 ms