Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5Y5

PEX16, Peroxisomal membrane protein PEX16, humanhuman

Predictions only

Length 336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX16Q9Y5Y5 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PEX16Q9Y5Y5 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PEX16Q9Y5Y5 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PEX16Q9Y5Y5 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PEX16Q9Y5Y5 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PEX16Q9Y5Y5 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PEX16Q9Y5Y5 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PEX16Q9Y5Y5 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PEX16Q9Y5Y5 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PEX16Q9Y5Y5 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PEX16Q9Y5Y5 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PEX16Q9Y5Y5 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PEX16Q9Y5Y5 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PEX16Q9Y5Y5 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PEX16Q9Y5Y5 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PEX16Q9Y5Y5 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PEX16Q9Y5Y5 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PEX16Q9Y5Y5 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PEX16Q9Y5Y5 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PEX16Q9Y5Y5 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PEX16Q9Y5Y5 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PEX16Q9Y5Y5 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PEX16Q9Y5Y5 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PEX16Q9Y5Y5 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PEX16Q9Y5Y5 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PEX16Q9Y5Y5 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PEX16Q9Y5Y5 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PEX16Q9Y5Y5 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PEX16Q9Y5Y5 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PEX16Q9Y5Y5 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PEX16Q9Y5Y5 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PEX16Q9Y5Y5 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PEX16Q9Y5Y5 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PEX16Q9Y5Y5 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PEX16Q9Y5Y5 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PEX16Q9Y5Y5 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PEX16Q9Y5Y5 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PEX16Q9Y5Y5 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PEX16Q9Y5Y5 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PEX16Q9Y5Y5 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PEX16Q9Y5Y5 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PEX16Q9Y5Y5 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PEX16Q9Y5Y5 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PEX16Q9Y5Y5 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PEX16Q9Y5Y5 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
PEX16Q9Y5Y5 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PEX16Q9Y5Y5 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PEX16Q9Y5Y5 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PEX16Q9Y5Y5 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PEX16Q9Y5Y5 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PEX16Q9Y5Y5 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PEX16Q9Y5Y5 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
PEX16Q9Y5Y5 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PEX16Q9Y5Y5 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PEX16Q9Y5Y5 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PEX16Q9Y5Y5 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PEX16Q9Y5Y5 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PEX16Q9Y5Y5 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PEX16Q9Y5Y5 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PEX16Q9Y5Y5 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PEX16Q9Y5Y5 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PEX16Q9Y5Y5 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PEX16Q9Y5Y5 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PEX16Q9Y5Y5 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PEX16Q9Y5Y5 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PEX16Q9Y5Y5 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PEX16Q9Y5Y5 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PEX16Q9Y5Y5 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PEX16Q9Y5Y5 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PEX16Q9Y5Y5 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PEX16Q9Y5Y5 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PEX16Q9Y5Y5 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PEX16Q9Y5Y5 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PEX16Q9Y5Y5 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PEX16Q9Y5Y5 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PEX16Q9Y5Y5 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PEX16Q9Y5Y5 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PEX16Q9Y5Y5 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PEX16Q9Y5Y5 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PEX16Q9Y5Y5 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PEX16Q9Y5Y5 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PEX16Q9Y5Y5 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PEX16Q9Y5Y5 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PEX16Q9Y5Y5 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PEX16Q9Y5Y5 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PEX16Q9Y5Y5 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PEX16Q9Y5Y5 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PEX16Q9Y5Y5 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PEX16Q9Y5Y5 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PEX16Q9Y5Y5 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PEX16Q9Y5Y5 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PEX16Q9Y5Y5 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PEX16Q9Y5Y5 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PEX16Q9Y5Y5 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PEX16Q9Y5Y5 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PEX16Q9Y5Y5 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PEX16Q9Y5Y5 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PEX16Q9Y5Y5 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PEX16Q9Y5Y5 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.34
PEX16Q9Y5Y5 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.2 ms