Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5P4

COL4A3BP, Collagen type IV alpha-3-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 624 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL4A3BPQ9Y5P4 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
COL4A3BPQ9Y5P4 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC29.88■■■□□ 2.37
COL4A3BPQ9Y5P4 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
COL4A3BPQ9Y5P4 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
COL4A3BPQ9Y5P4 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
COL4A3BPQ9Y5P4 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
COL4A3BPQ9Y5P4 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
COL4A3BPQ9Y5P4 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC29.85■■■□□ 2.37
COL4A3BPQ9Y5P4 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
COL4A3BPQ9Y5P4 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
COL4A3BPQ9Y5P4 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
COL4A3BPQ9Y5P4 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
COL4A3BPQ9Y5P4 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
COL4A3BPQ9Y5P4 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
COL4A3BPQ9Y5P4 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
COL4A3BPQ9Y5P4 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
COL4A3BPQ9Y5P4 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC29.8■■■□□ 2.36
COL4A3BPQ9Y5P4 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
COL4A3BPQ9Y5P4 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
COL4A3BPQ9Y5P4 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
COL4A3BPQ9Y5P4 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
COL4A3BPQ9Y5P4 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
COL4A3BPQ9Y5P4 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC29.76■■■□□ 2.36
COL4A3BPQ9Y5P4 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
COL4A3BPQ9Y5P4 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
COL4A3BPQ9Y5P4 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
COL4A3BPQ9Y5P4 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
COL4A3BPQ9Y5P4 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
COL4A3BPQ9Y5P4 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
COL4A3BPQ9Y5P4 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
COL4A3BPQ9Y5P4 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
COL4A3BPQ9Y5P4 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
COL4A3BPQ9Y5P4 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
COL4A3BPQ9Y5P4 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
COL4A3BPQ9Y5P4 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
COL4A3BPQ9Y5P4 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC29.72■■■□□ 2.35
COL4A3BPQ9Y5P4 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
COL4A3BPQ9Y5P4 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
COL4A3BPQ9Y5P4 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
COL4A3BPQ9Y5P4 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.35
COL4A3BPQ9Y5P4 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
COL4A3BPQ9Y5P4 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
COL4A3BPQ9Y5P4 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
COL4A3BPQ9Y5P4 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
COL4A3BPQ9Y5P4 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
COL4A3BPQ9Y5P4 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
COL4A3BPQ9Y5P4 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC29.68■■■□□ 2.34
COL4A3BPQ9Y5P4 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
COL4A3BPQ9Y5P4 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC29.67■■■□□ 2.34
COL4A3BPQ9Y5P4 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
COL4A3BPQ9Y5P4 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
COL4A3BPQ9Y5P4 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
COL4A3BPQ9Y5P4 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
COL4A3BPQ9Y5P4 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
COL4A3BPQ9Y5P4 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC29.64■■■□□ 2.34
COL4A3BPQ9Y5P4 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC29.64■■■□□ 2.34
COL4A3BPQ9Y5P4 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
COL4A3BPQ9Y5P4 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
COL4A3BPQ9Y5P4 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
COL4A3BPQ9Y5P4 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
COL4A3BPQ9Y5P4 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
COL4A3BPQ9Y5P4 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
COL4A3BPQ9Y5P4 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
COL4A3BPQ9Y5P4 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
COL4A3BPQ9Y5P4 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
COL4A3BPQ9Y5P4 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
COL4A3BPQ9Y5P4 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
COL4A3BPQ9Y5P4 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
COL4A3BPQ9Y5P4 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
COL4A3BPQ9Y5P4 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
COL4A3BPQ9Y5P4 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
COL4A3BPQ9Y5P4 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
COL4A3BPQ9Y5P4 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
COL4A3BPQ9Y5P4 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
COL4A3BPQ9Y5P4 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
COL4A3BPQ9Y5P4 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
COL4A3BPQ9Y5P4 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
COL4A3BPQ9Y5P4 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
COL4A3BPQ9Y5P4 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
COL4A3BPQ9Y5P4 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC29.54■■■□□ 2.32
COL4A3BPQ9Y5P4 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
COL4A3BPQ9Y5P4 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
COL4A3BPQ9Y5P4 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
COL4A3BPQ9Y5P4 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
COL4A3BPQ9Y5P4 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
COL4A3BPQ9Y5P4 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
COL4A3BPQ9Y5P4 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
COL4A3BPQ9Y5P4 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
COL4A3BPQ9Y5P4 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
COL4A3BPQ9Y5P4 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC29.51■■■□□ 2.31
COL4A3BPQ9Y5P4 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
COL4A3BPQ9Y5P4 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC29.5■■■□□ 2.31
COL4A3BPQ9Y5P4 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC29.49■■■□□ 2.31
COL4A3BPQ9Y5P4 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
COL4A3BPQ9Y5P4 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
COL4A3BPQ9Y5P4 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
COL4A3BPQ9Y5P4 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
COL4A3BPQ9Y5P4 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
COL4A3BPQ9Y5P4 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
COL4A3BPQ9Y5P4 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.3 ms