Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3T6

R3HCC1, R3H and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
R3HCC1Q9Y3T6 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
R3HCC1Q9Y3T6 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
R3HCC1Q9Y3T6 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
R3HCC1Q9Y3T6 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
R3HCC1Q9Y3T6 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
R3HCC1Q9Y3T6 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
R3HCC1Q9Y3T6 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC30■■■□□ 2.39
R3HCC1Q9Y3T6 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
R3HCC1Q9Y3T6 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
R3HCC1Q9Y3T6 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
R3HCC1Q9Y3T6 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
R3HCC1Q9Y3T6 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
R3HCC1Q9Y3T6 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
R3HCC1Q9Y3T6 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
R3HCC1Q9Y3T6 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
R3HCC1Q9Y3T6 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
R3HCC1Q9Y3T6 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
R3HCC1Q9Y3T6 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.39
R3HCC1Q9Y3T6 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
R3HCC1Q9Y3T6 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
R3HCC1Q9Y3T6 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
R3HCC1Q9Y3T6 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
R3HCC1Q9Y3T6 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
R3HCC1Q9Y3T6 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC29.94■■■□□ 2.38
R3HCC1Q9Y3T6 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC29.94■■■□□ 2.38
R3HCC1Q9Y3T6 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
R3HCC1Q9Y3T6 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
R3HCC1Q9Y3T6 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
R3HCC1Q9Y3T6 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
R3HCC1Q9Y3T6 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
R3HCC1Q9Y3T6 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
R3HCC1Q9Y3T6 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC29.89■■■□□ 2.37
R3HCC1Q9Y3T6 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
R3HCC1Q9Y3T6 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
R3HCC1Q9Y3T6 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
R3HCC1Q9Y3T6 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
R3HCC1Q9Y3T6 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
R3HCC1Q9Y3T6 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC29.84■■■□□ 2.37
R3HCC1Q9Y3T6 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC29.84■■■□□ 2.37
R3HCC1Q9Y3T6 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC29.84■■■□□ 2.37
R3HCC1Q9Y3T6 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
R3HCC1Q9Y3T6 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
R3HCC1Q9Y3T6 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
R3HCC1Q9Y3T6 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
R3HCC1Q9Y3T6 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
R3HCC1Q9Y3T6 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
R3HCC1Q9Y3T6 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
R3HCC1Q9Y3T6 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
R3HCC1Q9Y3T6 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
R3HCC1Q9Y3T6 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
R3HCC1Q9Y3T6 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
R3HCC1Q9Y3T6 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
R3HCC1Q9Y3T6 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
R3HCC1Q9Y3T6 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
R3HCC1Q9Y3T6 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
R3HCC1Q9Y3T6 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
R3HCC1Q9Y3T6 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
R3HCC1Q9Y3T6 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
R3HCC1Q9Y3T6 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
R3HCC1Q9Y3T6 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
R3HCC1Q9Y3T6 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
R3HCC1Q9Y3T6 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
R3HCC1Q9Y3T6 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
R3HCC1Q9Y3T6 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
R3HCC1Q9Y3T6 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
R3HCC1Q9Y3T6 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
R3HCC1Q9Y3T6 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
R3HCC1Q9Y3T6 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
R3HCC1Q9Y3T6 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
R3HCC1Q9Y3T6 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
R3HCC1Q9Y3T6 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
R3HCC1Q9Y3T6 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC29.69■■■□□ 2.34
R3HCC1Q9Y3T6 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
R3HCC1Q9Y3T6 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
R3HCC1Q9Y3T6 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
R3HCC1Q9Y3T6 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
R3HCC1Q9Y3T6 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC29.68■■■□□ 2.34
R3HCC1Q9Y3T6 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
R3HCC1Q9Y3T6 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
R3HCC1Q9Y3T6 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC29.65■■■□□ 2.34
R3HCC1Q9Y3T6 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
R3HCC1Q9Y3T6 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
R3HCC1Q9Y3T6 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
R3HCC1Q9Y3T6 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC29.63■■■□□ 2.33
R3HCC1Q9Y3T6 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
R3HCC1Q9Y3T6 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
R3HCC1Q9Y3T6 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
R3HCC1Q9Y3T6 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
R3HCC1Q9Y3T6 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC29.61■■■□□ 2.33
R3HCC1Q9Y3T6 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
R3HCC1Q9Y3T6 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
R3HCC1Q9Y3T6 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
R3HCC1Q9Y3T6 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
R3HCC1Q9Y3T6 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
R3HCC1Q9Y3T6 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
R3HCC1Q9Y3T6 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
R3HCC1Q9Y3T6 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
R3HCC1Q9Y3T6 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
R3HCC1Q9Y3T6 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
R3HCC1Q9Y3T6 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.1 ms