Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3B3

TMED7, Transmembrane emp24 domain-containing protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMED7Q9Y3B3 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TMED7Q9Y3B3 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TMED7Q9Y3B3 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TMED7Q9Y3B3 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TMED7Q9Y3B3 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TMED7Q9Y3B3 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TMED7Q9Y3B3 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TMED7Q9Y3B3 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TMED7Q9Y3B3 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TMED7Q9Y3B3 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TMED7Q9Y3B3 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TMED7Q9Y3B3 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TMED7Q9Y3B3 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TMED7Q9Y3B3 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TMED7Q9Y3B3 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TMED7Q9Y3B3 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TMED7Q9Y3B3 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TMED7Q9Y3B3 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TMED7Q9Y3B3 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TMED7Q9Y3B3 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TMED7Q9Y3B3 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TMED7Q9Y3B3 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TMED7Q9Y3B3 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
TMED7Q9Y3B3 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TMED7Q9Y3B3 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TMED7Q9Y3B3 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TMED7Q9Y3B3 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TMED7Q9Y3B3 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TMED7Q9Y3B3 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TMED7Q9Y3B3 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
TMED7Q9Y3B3 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TMED7Q9Y3B3 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
TMED7Q9Y3B3 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TMED7Q9Y3B3 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TMED7Q9Y3B3 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
TMED7Q9Y3B3 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TMED7Q9Y3B3 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TMED7Q9Y3B3 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TMED7Q9Y3B3 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TMED7Q9Y3B3 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TMED7Q9Y3B3 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
TMED7Q9Y3B3 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TMED7Q9Y3B3 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TMED7Q9Y3B3 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TMED7Q9Y3B3 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TMED7Q9Y3B3 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TMED7Q9Y3B3 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
TMED7Q9Y3B3 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TMED7Q9Y3B3 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TMED7Q9Y3B3 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TMED7Q9Y3B3 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TMED7Q9Y3B3 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TMED7Q9Y3B3 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TMED7Q9Y3B3 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TMED7Q9Y3B3 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TMED7Q9Y3B3 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
TMED7Q9Y3B3 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TMED7Q9Y3B3 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TMED7Q9Y3B3 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
TMED7Q9Y3B3 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TMED7Q9Y3B3 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TMED7Q9Y3B3 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TMED7Q9Y3B3 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TMED7Q9Y3B3 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TMED7Q9Y3B3 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TMED7Q9Y3B3 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TMED7Q9Y3B3 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TMED7Q9Y3B3 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TMED7Q9Y3B3 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TMED7Q9Y3B3 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TMED7Q9Y3B3 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TMED7Q9Y3B3 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TMED7Q9Y3B3 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TMED7Q9Y3B3 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TMED7Q9Y3B3 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TMED7Q9Y3B3 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TMED7Q9Y3B3 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TMED7Q9Y3B3 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TMED7Q9Y3B3 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TMED7Q9Y3B3 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TMED7Q9Y3B3 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
TMED7Q9Y3B3 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TMED7Q9Y3B3 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TMED7Q9Y3B3 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TMED7Q9Y3B3 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
TMED7Q9Y3B3 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
TMED7Q9Y3B3 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TMED7Q9Y3B3 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TMED7Q9Y3B3 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TMED7Q9Y3B3 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TMED7Q9Y3B3 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TMED7Q9Y3B3 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TMED7Q9Y3B3 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TMED7Q9Y3B3 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TMED7Q9Y3B3 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TMED7Q9Y3B3 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TMED7Q9Y3B3 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TMED7Q9Y3B3 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TMED7Q9Y3B3 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TMED7Q9Y3B3 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14 ms