Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y256

RCE1, CAAX prenyl protease 2, humanhuman

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCE1Q9Y256 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RCE1Q9Y256 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
RCE1Q9Y256 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
RCE1Q9Y256 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
RCE1Q9Y256 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
RCE1Q9Y256 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
RCE1Q9Y256 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
RCE1Q9Y256 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
RCE1Q9Y256 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
RCE1Q9Y256 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RCE1Q9Y256 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
RCE1Q9Y256 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
RCE1Q9Y256 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RCE1Q9Y256 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
RCE1Q9Y256 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RCE1Q9Y256 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
RCE1Q9Y256 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
RCE1Q9Y256 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
RCE1Q9Y256 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
RCE1Q9Y256 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RCE1Q9Y256 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RCE1Q9Y256 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
RCE1Q9Y256 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
RCE1Q9Y256 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
RCE1Q9Y256 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RCE1Q9Y256 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RCE1Q9Y256 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
RCE1Q9Y256 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
RCE1Q9Y256 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RCE1Q9Y256 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RCE1Q9Y256 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
RCE1Q9Y256 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RCE1Q9Y256 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RCE1Q9Y256 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RCE1Q9Y256 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RCE1Q9Y256 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
RCE1Q9Y256 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RCE1Q9Y256 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RCE1Q9Y256 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RCE1Q9Y256 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
RCE1Q9Y256 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RCE1Q9Y256 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
RCE1Q9Y256 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
RCE1Q9Y256 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RCE1Q9Y256 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RCE1Q9Y256 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RCE1Q9Y256 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RCE1Q9Y256 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RCE1Q9Y256 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RCE1Q9Y256 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RCE1Q9Y256 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RCE1Q9Y256 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RCE1Q9Y256 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RCE1Q9Y256 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
RCE1Q9Y256 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RCE1Q9Y256 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RCE1Q9Y256 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RCE1Q9Y256 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RCE1Q9Y256 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RCE1Q9Y256 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RCE1Q9Y256 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RCE1Q9Y256 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RCE1Q9Y256 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RCE1Q9Y256 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RCE1Q9Y256 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RCE1Q9Y256 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RCE1Q9Y256 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RCE1Q9Y256 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
RCE1Q9Y256 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RCE1Q9Y256 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
RCE1Q9Y256 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RCE1Q9Y256 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RCE1Q9Y256 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
RCE1Q9Y256 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RCE1Q9Y256 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RCE1Q9Y256 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RCE1Q9Y256 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RCE1Q9Y256 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RCE1Q9Y256 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RCE1Q9Y256 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RCE1Q9Y256 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RCE1Q9Y256 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
RCE1Q9Y256 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
RCE1Q9Y256 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
RCE1Q9Y256 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
RCE1Q9Y256 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
RCE1Q9Y256 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RCE1Q9Y256 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
RCE1Q9Y256 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RCE1Q9Y256 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RCE1Q9Y256 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RCE1Q9Y256 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RCE1Q9Y256 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
RCE1Q9Y256 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RCE1Q9Y256 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RCE1Q9Y256 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RCE1Q9Y256 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RCE1Q9Y256 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RCE1Q9Y256 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RCE1Q9Y256 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.2 ms