Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMQ3

BARX2, Homeobox protein BarH-like 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 279 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BARX2Q9UMQ3 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
BARX2Q9UMQ3 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
BARX2Q9UMQ3 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
BARX2Q9UMQ3 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
BARX2Q9UMQ3 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
BARX2Q9UMQ3 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
BARX2Q9UMQ3 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
BARX2Q9UMQ3 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
BARX2Q9UMQ3 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
BARX2Q9UMQ3 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
BARX2Q9UMQ3 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC29.01■■■□□ 2.23
BARX2Q9UMQ3 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
BARX2Q9UMQ3 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC29■■■□□ 2.23
BARX2Q9UMQ3 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29■■■□□ 2.23
BARX2Q9UMQ3 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
BARX2Q9UMQ3 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
BARX2Q9UMQ3 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
BARX2Q9UMQ3 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
BARX2Q9UMQ3 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
BARX2Q9UMQ3 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC28.98■■■□□ 2.23
BARX2Q9UMQ3 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
BARX2Q9UMQ3 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
BARX2Q9UMQ3 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
BARX2Q9UMQ3 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
BARX2Q9UMQ3 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
BARX2Q9UMQ3 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC28.95■■■□□ 2.23
BARX2Q9UMQ3 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC28.95■■■□□ 2.22
BARX2Q9UMQ3 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
BARX2Q9UMQ3 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
BARX2Q9UMQ3 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
BARX2Q9UMQ3 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
BARX2Q9UMQ3 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC28.92■■■□□ 2.22
BARX2Q9UMQ3 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
BARX2Q9UMQ3 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
BARX2Q9UMQ3 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
BARX2Q9UMQ3 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
BARX2Q9UMQ3 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
BARX2Q9UMQ3 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
BARX2Q9UMQ3 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
BARX2Q9UMQ3 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
BARX2Q9UMQ3 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
BARX2Q9UMQ3 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
BARX2Q9UMQ3 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
BARX2Q9UMQ3 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
BARX2Q9UMQ3 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
BARX2Q9UMQ3 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC28.84■■■□□ 2.21
BARX2Q9UMQ3 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
BARX2Q9UMQ3 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
BARX2Q9UMQ3 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
BARX2Q9UMQ3 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC28.82■■■□□ 2.2
BARX2Q9UMQ3 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
BARX2Q9UMQ3 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
BARX2Q9UMQ3 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
BARX2Q9UMQ3 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
BARX2Q9UMQ3 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
BARX2Q9UMQ3 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
BARX2Q9UMQ3 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
BARX2Q9UMQ3 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
BARX2Q9UMQ3 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
BARX2Q9UMQ3 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
BARX2Q9UMQ3 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
BARX2Q9UMQ3 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
BARX2Q9UMQ3 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
BARX2Q9UMQ3 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
BARX2Q9UMQ3 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
BARX2Q9UMQ3 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
BARX2Q9UMQ3 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC28.73■■■□□ 2.19
BARX2Q9UMQ3 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
BARX2Q9UMQ3 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
BARX2Q9UMQ3 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
BARX2Q9UMQ3 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
BARX2Q9UMQ3 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
BARX2Q9UMQ3 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC28.7■■■□□ 2.18
BARX2Q9UMQ3 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
BARX2Q9UMQ3 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
BARX2Q9UMQ3 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
BARX2Q9UMQ3 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
BARX2Q9UMQ3 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
BARX2Q9UMQ3 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
BARX2Q9UMQ3 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
BARX2Q9UMQ3 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC28.65■■■□□ 2.18
BARX2Q9UMQ3 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
BARX2Q9UMQ3 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
BARX2Q9UMQ3 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
BARX2Q9UMQ3 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
BARX2Q9UMQ3 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
BARX2Q9UMQ3 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
BARX2Q9UMQ3 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
BARX2Q9UMQ3 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
BARX2Q9UMQ3 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
BARX2Q9UMQ3 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
BARX2Q9UMQ3 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
BARX2Q9UMQ3 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
BARX2Q9UMQ3 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
BARX2Q9UMQ3 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
BARX2Q9UMQ3 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
BARX2Q9UMQ3 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
BARX2Q9UMQ3 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
BARX2Q9UMQ3 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
BARX2Q9UMQ3 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.1 ms