Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJQ1

LAMP5, Lysosome-associated membrane glycoprotein 5, humanhuman

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Length 280 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMP5Q9UJQ1 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
LAMP5Q9UJQ1 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
LAMP5Q9UJQ1 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
LAMP5Q9UJQ1 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
LAMP5Q9UJQ1 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
LAMP5Q9UJQ1 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
LAMP5Q9UJQ1 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
LAMP5Q9UJQ1 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
LAMP5Q9UJQ1 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
LAMP5Q9UJQ1 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
LAMP5Q9UJQ1 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
LAMP5Q9UJQ1 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
LAMP5Q9UJQ1 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
LAMP5Q9UJQ1 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
LAMP5Q9UJQ1 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
LAMP5Q9UJQ1 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LAMP5Q9UJQ1 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
LAMP5Q9UJQ1 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
LAMP5Q9UJQ1 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LAMP5Q9UJQ1 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
LAMP5Q9UJQ1 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LAMP5Q9UJQ1 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
LAMP5Q9UJQ1 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LAMP5Q9UJQ1 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
LAMP5Q9UJQ1 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LAMP5Q9UJQ1 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LAMP5Q9UJQ1 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LAMP5Q9UJQ1 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LAMP5Q9UJQ1 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LAMP5Q9UJQ1 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
LAMP5Q9UJQ1 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
LAMP5Q9UJQ1 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LAMP5Q9UJQ1 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
LAMP5Q9UJQ1 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LAMP5Q9UJQ1 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
LAMP5Q9UJQ1 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LAMP5Q9UJQ1 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LAMP5Q9UJQ1 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
LAMP5Q9UJQ1 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LAMP5Q9UJQ1 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
LAMP5Q9UJQ1 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
LAMP5Q9UJQ1 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LAMP5Q9UJQ1 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LAMP5Q9UJQ1 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LAMP5Q9UJQ1 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
LAMP5Q9UJQ1 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LAMP5Q9UJQ1 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
LAMP5Q9UJQ1 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LAMP5Q9UJQ1 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
LAMP5Q9UJQ1 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LAMP5Q9UJQ1 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
LAMP5Q9UJQ1 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
LAMP5Q9UJQ1 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LAMP5Q9UJQ1 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LAMP5Q9UJQ1 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LAMP5Q9UJQ1 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LAMP5Q9UJQ1 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LAMP5Q9UJQ1 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LAMP5Q9UJQ1 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LAMP5Q9UJQ1 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LAMP5Q9UJQ1 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LAMP5Q9UJQ1 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LAMP5Q9UJQ1 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LAMP5Q9UJQ1 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LAMP5Q9UJQ1 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LAMP5Q9UJQ1 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LAMP5Q9UJQ1 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
LAMP5Q9UJQ1 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LAMP5Q9UJQ1 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
LAMP5Q9UJQ1 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
LAMP5Q9UJQ1 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
LAMP5Q9UJQ1 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LAMP5Q9UJQ1 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LAMP5Q9UJQ1 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LAMP5Q9UJQ1 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LAMP5Q9UJQ1 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LAMP5Q9UJQ1 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LAMP5Q9UJQ1 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
LAMP5Q9UJQ1 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LAMP5Q9UJQ1 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LAMP5Q9UJQ1 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LAMP5Q9UJQ1 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LAMP5Q9UJQ1 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
LAMP5Q9UJQ1 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LAMP5Q9UJQ1 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LAMP5Q9UJQ1 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LAMP5Q9UJQ1 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LAMP5Q9UJQ1 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LAMP5Q9UJQ1 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LAMP5Q9UJQ1 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
LAMP5Q9UJQ1 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
LAMP5Q9UJQ1 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LAMP5Q9UJQ1 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LAMP5Q9UJQ1 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LAMP5Q9UJQ1 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
LAMP5Q9UJQ1 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LAMP5Q9UJQ1 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LAMP5Q9UJQ1 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
LAMP5Q9UJQ1 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
LAMP5Q9UJQ1 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
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