Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHX1

PUF60, Poly(U)-binding-splicing factor PUF60, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUF60Q9UHX1 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
PUF60Q9UHX1 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
PUF60Q9UHX1 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
PUF60Q9UHX1 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
PUF60Q9UHX1 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
PUF60Q9UHX1 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
PUF60Q9UHX1 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
PUF60Q9UHX1 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
PUF60Q9UHX1 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
PUF60Q9UHX1 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
PUF60Q9UHX1 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
PUF60Q9UHX1 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC29.54■■■□□ 2.32
PUF60Q9UHX1 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
PUF60Q9UHX1 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
PUF60Q9UHX1 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
PUF60Q9UHX1 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
PUF60Q9UHX1 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
PUF60Q9UHX1 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
PUF60Q9UHX1 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
PUF60Q9UHX1 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
PUF60Q9UHX1 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
PUF60Q9UHX1 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
PUF60Q9UHX1 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
PUF60Q9UHX1 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
PUF60Q9UHX1 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
PUF60Q9UHX1 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
PUF60Q9UHX1 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC29.43■■■□□ 2.3
PUF60Q9UHX1 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
PUF60Q9UHX1 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
PUF60Q9UHX1 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
PUF60Q9UHX1 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
PUF60Q9UHX1 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
PUF60Q9UHX1 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
PUF60Q9UHX1 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
PUF60Q9UHX1 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
PUF60Q9UHX1 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
PUF60Q9UHX1 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
PUF60Q9UHX1 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
PUF60Q9UHX1 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC29.37■■■□□ 2.29
PUF60Q9UHX1 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
PUF60Q9UHX1 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
PUF60Q9UHX1 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
PUF60Q9UHX1 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
PUF60Q9UHX1 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
PUF60Q9UHX1 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
PUF60Q9UHX1 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
PUF60Q9UHX1 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
PUF60Q9UHX1 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.35■■■□□ 2.29
PUF60Q9UHX1 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
PUF60Q9UHX1 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
PUF60Q9UHX1 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
PUF60Q9UHX1 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
PUF60Q9UHX1 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
PUF60Q9UHX1 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
PUF60Q9UHX1 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
PUF60Q9UHX1 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
PUF60Q9UHX1 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
PUF60Q9UHX1 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
PUF60Q9UHX1 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
PUF60Q9UHX1 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
PUF60Q9UHX1 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC29.32■■■□□ 2.28
PUF60Q9UHX1 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC29.32■■■□□ 2.28
PUF60Q9UHX1 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
PUF60Q9UHX1 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
PUF60Q9UHX1 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
PUF60Q9UHX1 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
PUF60Q9UHX1 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
PUF60Q9UHX1 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC29.3■■■□□ 2.28
PUF60Q9UHX1 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
PUF60Q9UHX1 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
PUF60Q9UHX1 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
PUF60Q9UHX1 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
PUF60Q9UHX1 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
PUF60Q9UHX1 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
PUF60Q9UHX1 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
PUF60Q9UHX1 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
PUF60Q9UHX1 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
PUF60Q9UHX1 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
PUF60Q9UHX1 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
PUF60Q9UHX1 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
PUF60Q9UHX1 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
PUF60Q9UHX1 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC29.26■■■□□ 2.27
PUF60Q9UHX1 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
PUF60Q9UHX1 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
PUF60Q9UHX1 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
PUF60Q9UHX1 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
PUF60Q9UHX1 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
PUF60Q9UHX1 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
PUF60Q9UHX1 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC29.23■■■□□ 2.27
PUF60Q9UHX1 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
PUF60Q9UHX1 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
PUF60Q9UHX1 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
PUF60Q9UHX1 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
PUF60Q9UHX1 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
PUF60Q9UHX1 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
PUF60Q9UHX1 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
PUF60Q9UHX1 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
PUF60Q9UHX1 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
PUF60Q9UHX1 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
PUF60Q9UHX1 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms