Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHD9

UBQLN2, Ubiquilin-2, humanhuman

Predictions only

Length 624 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBQLN2Q9UHD9 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
UBQLN2Q9UHD9 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
UBQLN2Q9UHD9 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
UBQLN2Q9UHD9 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
UBQLN2Q9UHD9 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
UBQLN2Q9UHD9 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
UBQLN2Q9UHD9 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
UBQLN2Q9UHD9 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
UBQLN2Q9UHD9 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
UBQLN2Q9UHD9 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
UBQLN2Q9UHD9 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
UBQLN2Q9UHD9 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
UBQLN2Q9UHD9 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
UBQLN2Q9UHD9 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
UBQLN2Q9UHD9 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
UBQLN2Q9UHD9 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
UBQLN2Q9UHD9 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
UBQLN2Q9UHD9 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
UBQLN2Q9UHD9 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
UBQLN2Q9UHD9 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
UBQLN2Q9UHD9 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
UBQLN2Q9UHD9 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
UBQLN2Q9UHD9 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
UBQLN2Q9UHD9 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
UBQLN2Q9UHD9 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
UBQLN2Q9UHD9 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
UBQLN2Q9UHD9 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
UBQLN2Q9UHD9 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
UBQLN2Q9UHD9 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
UBQLN2Q9UHD9 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
UBQLN2Q9UHD9 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
UBQLN2Q9UHD9 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
UBQLN2Q9UHD9 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
UBQLN2Q9UHD9 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
UBQLN2Q9UHD9 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
UBQLN2Q9UHD9 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
UBQLN2Q9UHD9 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
UBQLN2Q9UHD9 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
UBQLN2Q9UHD9 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
UBQLN2Q9UHD9 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
UBQLN2Q9UHD9 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
UBQLN2Q9UHD9 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
UBQLN2Q9UHD9 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
UBQLN2Q9UHD9 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
UBQLN2Q9UHD9 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
UBQLN2Q9UHD9 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
UBQLN2Q9UHD9 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
UBQLN2Q9UHD9 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
UBQLN2Q9UHD9 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
UBQLN2Q9UHD9 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
UBQLN2Q9UHD9 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
UBQLN2Q9UHD9 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
UBQLN2Q9UHD9 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
UBQLN2Q9UHD9 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
UBQLN2Q9UHD9 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
UBQLN2Q9UHD9 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
UBQLN2Q9UHD9 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
UBQLN2Q9UHD9 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
UBQLN2Q9UHD9 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
UBQLN2Q9UHD9 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
UBQLN2Q9UHD9 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
UBQLN2Q9UHD9 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
UBQLN2Q9UHD9 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
UBQLN2Q9UHD9 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
UBQLN2Q9UHD9 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
UBQLN2Q9UHD9 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
UBQLN2Q9UHD9 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
UBQLN2Q9UHD9 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
UBQLN2Q9UHD9 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
UBQLN2Q9UHD9 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
UBQLN2Q9UHD9 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
UBQLN2Q9UHD9 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
UBQLN2Q9UHD9 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
UBQLN2Q9UHD9 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
UBQLN2Q9UHD9 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
UBQLN2Q9UHD9 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
UBQLN2Q9UHD9 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
UBQLN2Q9UHD9 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
UBQLN2Q9UHD9 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
UBQLN2Q9UHD9 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
UBQLN2Q9UHD9 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
UBQLN2Q9UHD9 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
UBQLN2Q9UHD9 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
UBQLN2Q9UHD9 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
UBQLN2Q9UHD9 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
UBQLN2Q9UHD9 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
UBQLN2Q9UHD9 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
UBQLN2Q9UHD9 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
UBQLN2Q9UHD9 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
UBQLN2Q9UHD9 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
UBQLN2Q9UHD9 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
UBQLN2Q9UHD9 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
UBQLN2Q9UHD9 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
UBQLN2Q9UHD9 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
UBQLN2Q9UHD9 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
UBQLN2Q9UHD9 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
UBQLN2Q9UHD9 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
UBQLN2Q9UHD9 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
UBQLN2Q9UHD9 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
UBQLN2Q9UHD9 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.6 ms