Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBY8

CLN8, Protein CLN8, humanhuman

Predictions only

Length 286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN8Q9UBY8 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CLN8Q9UBY8 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CLN8Q9UBY8 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CLN8Q9UBY8 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CLN8Q9UBY8 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CLN8Q9UBY8 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CLN8Q9UBY8 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CLN8Q9UBY8 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CLN8Q9UBY8 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CLN8Q9UBY8 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CLN8Q9UBY8 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CLN8Q9UBY8 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CLN8Q9UBY8 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CLN8Q9UBY8 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CLN8Q9UBY8 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CLN8Q9UBY8 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CLN8Q9UBY8 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CLN8Q9UBY8 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CLN8Q9UBY8 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CLN8Q9UBY8 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CLN8Q9UBY8 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CLN8Q9UBY8 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CLN8Q9UBY8 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CLN8Q9UBY8 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CLN8Q9UBY8 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
CLN8Q9UBY8 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CLN8Q9UBY8 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CLN8Q9UBY8 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CLN8Q9UBY8 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CLN8Q9UBY8 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CLN8Q9UBY8 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CLN8Q9UBY8 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CLN8Q9UBY8 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CLN8Q9UBY8 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CLN8Q9UBY8 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CLN8Q9UBY8 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CLN8Q9UBY8 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CLN8Q9UBY8 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CLN8Q9UBY8 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CLN8Q9UBY8 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CLN8Q9UBY8 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CLN8Q9UBY8 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CLN8Q9UBY8 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CLN8Q9UBY8 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CLN8Q9UBY8 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CLN8Q9UBY8 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CLN8Q9UBY8 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CLN8Q9UBY8 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CLN8Q9UBY8 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CLN8Q9UBY8 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CLN8Q9UBY8 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CLN8Q9UBY8 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CLN8Q9UBY8 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CLN8Q9UBY8 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CLN8Q9UBY8 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CLN8Q9UBY8 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CLN8Q9UBY8 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CLN8Q9UBY8 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CLN8Q9UBY8 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CLN8Q9UBY8 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CLN8Q9UBY8 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CLN8Q9UBY8 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CLN8Q9UBY8 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CLN8Q9UBY8 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CLN8Q9UBY8 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CLN8Q9UBY8 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CLN8Q9UBY8 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CLN8Q9UBY8 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CLN8Q9UBY8 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CLN8Q9UBY8 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CLN8Q9UBY8 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CLN8Q9UBY8 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CLN8Q9UBY8 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CLN8Q9UBY8 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CLN8Q9UBY8 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CLN8Q9UBY8 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CLN8Q9UBY8 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CLN8Q9UBY8 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CLN8Q9UBY8 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CLN8Q9UBY8 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CLN8Q9UBY8 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CLN8Q9UBY8 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CLN8Q9UBY8 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CLN8Q9UBY8 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CLN8Q9UBY8 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CLN8Q9UBY8 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CLN8Q9UBY8 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CLN8Q9UBY8 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CLN8Q9UBY8 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CLN8Q9UBY8 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CLN8Q9UBY8 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CLN8Q9UBY8 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CLN8Q9UBY8 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CLN8Q9UBY8 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CLN8Q9UBY8 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CLN8Q9UBY8 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CLN8Q9UBY8 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CLN8Q9UBY8 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CLN8Q9UBY8 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CLN8Q9UBY8 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90.3 ms