Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBS4

DNAJB11, DnaJ homolog subfamily B member 11, humanhuman

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAJB11Q9UBS4 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
DNAJB11Q9UBS4 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
DNAJB11Q9UBS4 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
DNAJB11Q9UBS4 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
DNAJB11Q9UBS4 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
DNAJB11Q9UBS4 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
DNAJB11Q9UBS4 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
DNAJB11Q9UBS4 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
DNAJB11Q9UBS4 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
DNAJB11Q9UBS4 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
DNAJB11Q9UBS4 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
DNAJB11Q9UBS4 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
DNAJB11Q9UBS4 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
DNAJB11Q9UBS4 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
DNAJB11Q9UBS4 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
DNAJB11Q9UBS4 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
DNAJB11Q9UBS4 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
DNAJB11Q9UBS4 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
DNAJB11Q9UBS4 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
DNAJB11Q9UBS4 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
DNAJB11Q9UBS4 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
DNAJB11Q9UBS4 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
DNAJB11Q9UBS4 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
DNAJB11Q9UBS4 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
DNAJB11Q9UBS4 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
DNAJB11Q9UBS4 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
DNAJB11Q9UBS4 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
DNAJB11Q9UBS4 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
DNAJB11Q9UBS4 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
DNAJB11Q9UBS4 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
DNAJB11Q9UBS4 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
DNAJB11Q9UBS4 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
DNAJB11Q9UBS4 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
DNAJB11Q9UBS4 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
DNAJB11Q9UBS4 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
DNAJB11Q9UBS4 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
DNAJB11Q9UBS4 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
DNAJB11Q9UBS4 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
DNAJB11Q9UBS4 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
DNAJB11Q9UBS4 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
DNAJB11Q9UBS4 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
DNAJB11Q9UBS4 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
DNAJB11Q9UBS4 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
DNAJB11Q9UBS4 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
DNAJB11Q9UBS4 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
DNAJB11Q9UBS4 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
DNAJB11Q9UBS4 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
DNAJB11Q9UBS4 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
DNAJB11Q9UBS4 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
DNAJB11Q9UBS4 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
DNAJB11Q9UBS4 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
DNAJB11Q9UBS4 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
DNAJB11Q9UBS4 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
DNAJB11Q9UBS4 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
DNAJB11Q9UBS4 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
DNAJB11Q9UBS4 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
DNAJB11Q9UBS4 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
DNAJB11Q9UBS4 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
DNAJB11Q9UBS4 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
DNAJB11Q9UBS4 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
DNAJB11Q9UBS4 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
DNAJB11Q9UBS4 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
DNAJB11Q9UBS4 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
DNAJB11Q9UBS4 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
DNAJB11Q9UBS4 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
DNAJB11Q9UBS4 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
DNAJB11Q9UBS4 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
DNAJB11Q9UBS4 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
DNAJB11Q9UBS4 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
DNAJB11Q9UBS4 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
DNAJB11Q9UBS4 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
DNAJB11Q9UBS4 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
DNAJB11Q9UBS4 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
DNAJB11Q9UBS4 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
DNAJB11Q9UBS4 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
DNAJB11Q9UBS4 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
DNAJB11Q9UBS4 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
DNAJB11Q9UBS4 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
DNAJB11Q9UBS4 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
DNAJB11Q9UBS4 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
DNAJB11Q9UBS4 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
DNAJB11Q9UBS4 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
DNAJB11Q9UBS4 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
DNAJB11Q9UBS4 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
DNAJB11Q9UBS4 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
DNAJB11Q9UBS4 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
DNAJB11Q9UBS4 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
DNAJB11Q9UBS4 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
DNAJB11Q9UBS4 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
DNAJB11Q9UBS4 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
DNAJB11Q9UBS4 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
DNAJB11Q9UBS4 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
DNAJB11Q9UBS4 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
DNAJB11Q9UBS4 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
DNAJB11Q9UBS4 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
DNAJB11Q9UBS4 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
DNAJB11Q9UBS4 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
DNAJB11Q9UBS4 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
DNAJB11Q9UBS4 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
DNAJB11Q9UBS4 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms