Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBN4

TRPC4, Short transient receptor potential channel 4, humanhuman

Predictions only

Length 977 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPC4Q9UBN4 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TRPC4Q9UBN4 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TRPC4Q9UBN4 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TRPC4Q9UBN4 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TRPC4Q9UBN4 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TRPC4Q9UBN4 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
TRPC4Q9UBN4 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TRPC4Q9UBN4 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TRPC4Q9UBN4 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
TRPC4Q9UBN4 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
TRPC4Q9UBN4 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TRPC4Q9UBN4 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TRPC4Q9UBN4 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TRPC4Q9UBN4 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TRPC4Q9UBN4 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TRPC4Q9UBN4 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TRPC4Q9UBN4 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TRPC4Q9UBN4 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
TRPC4Q9UBN4 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TRPC4Q9UBN4 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TRPC4Q9UBN4 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TRPC4Q9UBN4 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
TRPC4Q9UBN4 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
TRPC4Q9UBN4 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TRPC4Q9UBN4 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TRPC4Q9UBN4 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TRPC4Q9UBN4 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TRPC4Q9UBN4 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TRPC4Q9UBN4 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TRPC4Q9UBN4 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TRPC4Q9UBN4 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TRPC4Q9UBN4 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TRPC4Q9UBN4 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TRPC4Q9UBN4 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TRPC4Q9UBN4 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TRPC4Q9UBN4 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TRPC4Q9UBN4 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TRPC4Q9UBN4 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TRPC4Q9UBN4 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
TRPC4Q9UBN4 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TRPC4Q9UBN4 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TRPC4Q9UBN4 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TRPC4Q9UBN4 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TRPC4Q9UBN4 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TRPC4Q9UBN4 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TRPC4Q9UBN4 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TRPC4Q9UBN4 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TRPC4Q9UBN4 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TRPC4Q9UBN4 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TRPC4Q9UBN4 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TRPC4Q9UBN4 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TRPC4Q9UBN4 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TRPC4Q9UBN4 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TRPC4Q9UBN4 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TRPC4Q9UBN4 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TRPC4Q9UBN4 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TRPC4Q9UBN4 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TRPC4Q9UBN4 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TRPC4Q9UBN4 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TRPC4Q9UBN4 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TRPC4Q9UBN4 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
TRPC4Q9UBN4 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TRPC4Q9UBN4 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TRPC4Q9UBN4 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TRPC4Q9UBN4 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TRPC4Q9UBN4 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TRPC4Q9UBN4 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TRPC4Q9UBN4 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TRPC4Q9UBN4 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TRPC4Q9UBN4 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TRPC4Q9UBN4 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TRPC4Q9UBN4 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TRPC4Q9UBN4 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TRPC4Q9UBN4 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TRPC4Q9UBN4 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC25.2■■□□□ 1.63
TRPC4Q9UBN4 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TRPC4Q9UBN4 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TRPC4Q9UBN4 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TRPC4Q9UBN4 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
TRPC4Q9UBN4 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TRPC4Q9UBN4 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TRPC4Q9UBN4 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TRPC4Q9UBN4 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TRPC4Q9UBN4 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TRPC4Q9UBN4 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TRPC4Q9UBN4 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TRPC4Q9UBN4 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TRPC4Q9UBN4 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TRPC4Q9UBN4 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TRPC4Q9UBN4 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TRPC4Q9UBN4 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TRPC4Q9UBN4 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
TRPC4Q9UBN4 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TRPC4Q9UBN4 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
TRPC4Q9UBN4 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
TRPC4Q9UBN4 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TRPC4Q9UBN4 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TRPC4Q9UBN4 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TRPC4Q9UBN4 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TRPC4Q9UBN4 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.1 ms