Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBM8

MGAT4C, Alpha-1,3-mannosyl-glycoprotein 4-beta-N-acetylglucosaminyltransferase C, humanhuman

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MGAT4CQ9UBM8 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
MGAT4CQ9UBM8 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MGAT4CQ9UBM8 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MGAT4CQ9UBM8 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
MGAT4CQ9UBM8 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MGAT4CQ9UBM8 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MGAT4CQ9UBM8 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MGAT4CQ9UBM8 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MGAT4CQ9UBM8 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MGAT4CQ9UBM8 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
MGAT4CQ9UBM8 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MGAT4CQ9UBM8 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MGAT4CQ9UBM8 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MGAT4CQ9UBM8 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MGAT4CQ9UBM8 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MGAT4CQ9UBM8 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MGAT4CQ9UBM8 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MGAT4CQ9UBM8 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MGAT4CQ9UBM8 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MGAT4CQ9UBM8 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MGAT4CQ9UBM8 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MGAT4CQ9UBM8 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MGAT4CQ9UBM8 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MGAT4CQ9UBM8 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MGAT4CQ9UBM8 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MGAT4CQ9UBM8 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MGAT4CQ9UBM8 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MGAT4CQ9UBM8 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MGAT4CQ9UBM8 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MGAT4CQ9UBM8 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MGAT4CQ9UBM8 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MGAT4CQ9UBM8 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MGAT4CQ9UBM8 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MGAT4CQ9UBM8 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
MGAT4CQ9UBM8 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
MGAT4CQ9UBM8 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MGAT4CQ9UBM8 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MGAT4CQ9UBM8 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MGAT4CQ9UBM8 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MGAT4CQ9UBM8 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
MGAT4CQ9UBM8 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MGAT4CQ9UBM8 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MGAT4CQ9UBM8 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MGAT4CQ9UBM8 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
MGAT4CQ9UBM8 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MGAT4CQ9UBM8 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MGAT4CQ9UBM8 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MGAT4CQ9UBM8 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MGAT4CQ9UBM8 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MGAT4CQ9UBM8 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MGAT4CQ9UBM8 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MGAT4CQ9UBM8 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MGAT4CQ9UBM8 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MGAT4CQ9UBM8 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
MGAT4CQ9UBM8 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MGAT4CQ9UBM8 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MGAT4CQ9UBM8 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MGAT4CQ9UBM8 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MGAT4CQ9UBM8 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MGAT4CQ9UBM8 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MGAT4CQ9UBM8 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
MGAT4CQ9UBM8 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
MGAT4CQ9UBM8 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MGAT4CQ9UBM8 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MGAT4CQ9UBM8 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MGAT4CQ9UBM8 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MGAT4CQ9UBM8 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MGAT4CQ9UBM8 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MGAT4CQ9UBM8 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MGAT4CQ9UBM8 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MGAT4CQ9UBM8 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MGAT4CQ9UBM8 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MGAT4CQ9UBM8 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MGAT4CQ9UBM8 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MGAT4CQ9UBM8 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MGAT4CQ9UBM8 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MGAT4CQ9UBM8 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MGAT4CQ9UBM8 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MGAT4CQ9UBM8 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MGAT4CQ9UBM8 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MGAT4CQ9UBM8 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MGAT4CQ9UBM8 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MGAT4CQ9UBM8 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MGAT4CQ9UBM8 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MGAT4CQ9UBM8 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MGAT4CQ9UBM8 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MGAT4CQ9UBM8 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MGAT4CQ9UBM8 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MGAT4CQ9UBM8 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MGAT4CQ9UBM8 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MGAT4CQ9UBM8 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MGAT4CQ9UBM8 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MGAT4CQ9UBM8 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MGAT4CQ9UBM8 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MGAT4CQ9UBM8 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MGAT4CQ9UBM8 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MGAT4CQ9UBM8 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MGAT4CQ9UBM8 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MGAT4CQ9UBM8 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MGAT4CQ9UBM8 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.4 ms