Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX36

DNAJC28, DnaJ homolog subfamily C member 28, humanhuman

Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAJC28Q9NX36 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
DNAJC28Q9NX36 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
DNAJC28Q9NX36 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
DNAJC28Q9NX36 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
DNAJC28Q9NX36 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
DNAJC28Q9NX36 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
DNAJC28Q9NX36 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
DNAJC28Q9NX36 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
DNAJC28Q9NX36 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
DNAJC28Q9NX36 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
DNAJC28Q9NX36 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
DNAJC28Q9NX36 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
DNAJC28Q9NX36 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
DNAJC28Q9NX36 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
DNAJC28Q9NX36 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
DNAJC28Q9NX36 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
DNAJC28Q9NX36 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
DNAJC28Q9NX36 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
DNAJC28Q9NX36 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
DNAJC28Q9NX36 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
DNAJC28Q9NX36 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
DNAJC28Q9NX36 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
DNAJC28Q9NX36 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
DNAJC28Q9NX36 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
DNAJC28Q9NX36 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
DNAJC28Q9NX36 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
DNAJC28Q9NX36 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
DNAJC28Q9NX36 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
DNAJC28Q9NX36 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
DNAJC28Q9NX36 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
DNAJC28Q9NX36 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
DNAJC28Q9NX36 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
DNAJC28Q9NX36 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
DNAJC28Q9NX36 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
DNAJC28Q9NX36 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
DNAJC28Q9NX36 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
DNAJC28Q9NX36 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
DNAJC28Q9NX36 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
DNAJC28Q9NX36 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
DNAJC28Q9NX36 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
DNAJC28Q9NX36 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
DNAJC28Q9NX36 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
DNAJC28Q9NX36 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
DNAJC28Q9NX36 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
DNAJC28Q9NX36 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
DNAJC28Q9NX36 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
DNAJC28Q9NX36 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
DNAJC28Q9NX36 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
DNAJC28Q9NX36 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
DNAJC28Q9NX36 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
DNAJC28Q9NX36 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
DNAJC28Q9NX36 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
DNAJC28Q9NX36 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
DNAJC28Q9NX36 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
DNAJC28Q9NX36 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
DNAJC28Q9NX36 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
DNAJC28Q9NX36 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
DNAJC28Q9NX36 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
DNAJC28Q9NX36 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
DNAJC28Q9NX36 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
DNAJC28Q9NX36 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
DNAJC28Q9NX36 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
DNAJC28Q9NX36 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
DNAJC28Q9NX36 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
DNAJC28Q9NX36 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
DNAJC28Q9NX36 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
DNAJC28Q9NX36 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
DNAJC28Q9NX36 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
DNAJC28Q9NX36 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
DNAJC28Q9NX36 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
DNAJC28Q9NX36 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
DNAJC28Q9NX36 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
DNAJC28Q9NX36 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
DNAJC28Q9NX36 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
DNAJC28Q9NX36 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
DNAJC28Q9NX36 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
DNAJC28Q9NX36 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
DNAJC28Q9NX36 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
DNAJC28Q9NX36 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
DNAJC28Q9NX36 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
DNAJC28Q9NX36 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
DNAJC28Q9NX36 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
DNAJC28Q9NX36 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
DNAJC28Q9NX36 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
DNAJC28Q9NX36 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
DNAJC28Q9NX36 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
DNAJC28Q9NX36 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
DNAJC28Q9NX36 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
DNAJC28Q9NX36 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
DNAJC28Q9NX36 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
DNAJC28Q9NX36 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
DNAJC28Q9NX36 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
DNAJC28Q9NX36 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
DNAJC28Q9NX36 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
DNAJC28Q9NX36 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
DNAJC28Q9NX36 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
DNAJC28Q9NX36 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
DNAJC28Q9NX36 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
DNAJC28Q9NX36 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
DNAJC28Q9NX36 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.3 ms