Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVC6

MED17, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 17, humanhuman

Predictions only

Length 651 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED17Q9NVC6 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
MED17Q9NVC6 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
MED17Q9NVC6 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
MED17Q9NVC6 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
MED17Q9NVC6 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
MED17Q9NVC6 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
MED17Q9NVC6 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
MED17Q9NVC6 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
MED17Q9NVC6 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
MED17Q9NVC6 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MED17Q9NVC6 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
MED17Q9NVC6 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
MED17Q9NVC6 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
MED17Q9NVC6 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
MED17Q9NVC6 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
MED17Q9NVC6 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
MED17Q9NVC6 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
MED17Q9NVC6 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
MED17Q9NVC6 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
MED17Q9NVC6 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
MED17Q9NVC6 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
MED17Q9NVC6 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
MED17Q9NVC6 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
MED17Q9NVC6 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
MED17Q9NVC6 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
MED17Q9NVC6 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
MED17Q9NVC6 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
MED17Q9NVC6 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MED17Q9NVC6 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
MED17Q9NVC6 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MED17Q9NVC6 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
MED17Q9NVC6 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
MED17Q9NVC6 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
MED17Q9NVC6 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MED17Q9NVC6 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
MED17Q9NVC6 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
MED17Q9NVC6 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
MED17Q9NVC6 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MED17Q9NVC6 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MED17Q9NVC6 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MED17Q9NVC6 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
MED17Q9NVC6 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MED17Q9NVC6 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
MED17Q9NVC6 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MED17Q9NVC6 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
MED17Q9NVC6 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
MED17Q9NVC6 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
MED17Q9NVC6 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
MED17Q9NVC6 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MED17Q9NVC6 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
MED17Q9NVC6 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MED17Q9NVC6 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MED17Q9NVC6 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
MED17Q9NVC6 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MED17Q9NVC6 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MED17Q9NVC6 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
MED17Q9NVC6 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MED17Q9NVC6 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
MED17Q9NVC6 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MED17Q9NVC6 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MED17Q9NVC6 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MED17Q9NVC6 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MED17Q9NVC6 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MED17Q9NVC6 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
MED17Q9NVC6 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MED17Q9NVC6 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MED17Q9NVC6 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MED17Q9NVC6 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MED17Q9NVC6 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
MED17Q9NVC6 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
MED17Q9NVC6 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
MED17Q9NVC6 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MED17Q9NVC6 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MED17Q9NVC6 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
MED17Q9NVC6 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MED17Q9NVC6 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
MED17Q9NVC6 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MED17Q9NVC6 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
MED17Q9NVC6 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
MED17Q9NVC6 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MED17Q9NVC6 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
MED17Q9NVC6 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
MED17Q9NVC6 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MED17Q9NVC6 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MED17Q9NVC6 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MED17Q9NVC6 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MED17Q9NVC6 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
MED17Q9NVC6 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
MED17Q9NVC6 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MED17Q9NVC6 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
MED17Q9NVC6 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MED17Q9NVC6 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MED17Q9NVC6 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MED17Q9NVC6 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
MED17Q9NVC6 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MED17Q9NVC6 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
MED17Q9NVC6 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
MED17Q9NVC6 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
MED17Q9NVC6 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
MED17Q9NVC6 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.5 ms