Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUV7

SPTLC3, Serine palmitoyltransferase 3, humanhuman

Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTLC3Q9NUV7 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
SPTLC3Q9NUV7 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
SPTLC3Q9NUV7 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
SPTLC3Q9NUV7 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
SPTLC3Q9NUV7 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
SPTLC3Q9NUV7 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
SPTLC3Q9NUV7 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
SPTLC3Q9NUV7 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC29.45■■■□□ 2.3
SPTLC3Q9NUV7 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
SPTLC3Q9NUV7 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
SPTLC3Q9NUV7 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
SPTLC3Q9NUV7 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
SPTLC3Q9NUV7 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC29.43■■■□□ 2.3
SPTLC3Q9NUV7 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
SPTLC3Q9NUV7 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
SPTLC3Q9NUV7 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
SPTLC3Q9NUV7 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
SPTLC3Q9NUV7 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
SPTLC3Q9NUV7 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
SPTLC3Q9NUV7 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
SPTLC3Q9NUV7 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
SPTLC3Q9NUV7 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
SPTLC3Q9NUV7 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
SPTLC3Q9NUV7 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
SPTLC3Q9NUV7 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.29
SPTLC3Q9NUV7 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
SPTLC3Q9NUV7 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
SPTLC3Q9NUV7 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
SPTLC3Q9NUV7 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
SPTLC3Q9NUV7 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
SPTLC3Q9NUV7 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
SPTLC3Q9NUV7 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
SPTLC3Q9NUV7 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
SPTLC3Q9NUV7 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC29.35■■■□□ 2.29
SPTLC3Q9NUV7 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
SPTLC3Q9NUV7 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
SPTLC3Q9NUV7 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
SPTLC3Q9NUV7 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
SPTLC3Q9NUV7 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
SPTLC3Q9NUV7 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
SPTLC3Q9NUV7 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
SPTLC3Q9NUV7 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
SPTLC3Q9NUV7 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC29.28■■■□□ 2.28
SPTLC3Q9NUV7 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
SPTLC3Q9NUV7 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
SPTLC3Q9NUV7 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
SPTLC3Q9NUV7 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
SPTLC3Q9NUV7 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
SPTLC3Q9NUV7 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
SPTLC3Q9NUV7 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
SPTLC3Q9NUV7 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
SPTLC3Q9NUV7 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
SPTLC3Q9NUV7 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
SPTLC3Q9NUV7 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
SPTLC3Q9NUV7 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
SPTLC3Q9NUV7 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
SPTLC3Q9NUV7 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
SPTLC3Q9NUV7 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
SPTLC3Q9NUV7 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
SPTLC3Q9NUV7 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
SPTLC3Q9NUV7 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
SPTLC3Q9NUV7 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
SPTLC3Q9NUV7 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
SPTLC3Q9NUV7 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
SPTLC3Q9NUV7 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
SPTLC3Q9NUV7 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
SPTLC3Q9NUV7 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
SPTLC3Q9NUV7 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
SPTLC3Q9NUV7 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
SPTLC3Q9NUV7 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
SPTLC3Q9NUV7 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
SPTLC3Q9NUV7 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
SPTLC3Q9NUV7 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
SPTLC3Q9NUV7 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
SPTLC3Q9NUV7 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
SPTLC3Q9NUV7 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
SPTLC3Q9NUV7 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
SPTLC3Q9NUV7 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
SPTLC3Q9NUV7 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
SPTLC3Q9NUV7 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
SPTLC3Q9NUV7 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
SPTLC3Q9NUV7 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
SPTLC3Q9NUV7 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
SPTLC3Q9NUV7 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
SPTLC3Q9NUV7 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
SPTLC3Q9NUV7 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
SPTLC3Q9NUV7 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
SPTLC3Q9NUV7 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
SPTLC3Q9NUV7 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
SPTLC3Q9NUV7 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
SPTLC3Q9NUV7 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
SPTLC3Q9NUV7 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.06■■■□□ 2.24
SPTLC3Q9NUV7 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC29.05■■■□□ 2.24
SPTLC3Q9NUV7 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
SPTLC3Q9NUV7 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
SPTLC3Q9NUV7 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
SPTLC3Q9NUV7 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
SPTLC3Q9NUV7 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
SPTLC3Q9NUV7 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
SPTLC3Q9NUV7 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.5 ms