Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSD4

ZNF275, Zinc finger protein 275, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 429 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF275Q9NSD4 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ZNF275Q9NSD4 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ZNF275Q9NSD4 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ZNF275Q9NSD4 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ZNF275Q9NSD4 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ZNF275Q9NSD4 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ZNF275Q9NSD4 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ZNF275Q9NSD4 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ZNF275Q9NSD4 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ZNF275Q9NSD4 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ZNF275Q9NSD4 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ZNF275Q9NSD4 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ZNF275Q9NSD4 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZNF275Q9NSD4 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZNF275Q9NSD4 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZNF275Q9NSD4 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZNF275Q9NSD4 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZNF275Q9NSD4 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ZNF275Q9NSD4 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ZNF275Q9NSD4 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ZNF275Q9NSD4 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ZNF275Q9NSD4 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ZNF275Q9NSD4 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ZNF275Q9NSD4 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ZNF275Q9NSD4 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ZNF275Q9NSD4 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ZNF275Q9NSD4 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ZNF275Q9NSD4 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
ZNF275Q9NSD4 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
ZNF275Q9NSD4 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ZNF275Q9NSD4 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ZNF275Q9NSD4 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ZNF275Q9NSD4 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ZNF275Q9NSD4 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ZNF275Q9NSD4 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ZNF275Q9NSD4 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ZNF275Q9NSD4 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ZNF275Q9NSD4 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ZNF275Q9NSD4 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ZNF275Q9NSD4 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ZNF275Q9NSD4 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ZNF275Q9NSD4 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ZNF275Q9NSD4 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ZNF275Q9NSD4 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ZNF275Q9NSD4 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ZNF275Q9NSD4 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ZNF275Q9NSD4 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ZNF275Q9NSD4 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ZNF275Q9NSD4 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
ZNF275Q9NSD4 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ZNF275Q9NSD4 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ZNF275Q9NSD4 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ZNF275Q9NSD4 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
ZNF275Q9NSD4 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ZNF275Q9NSD4 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ZNF275Q9NSD4 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ZNF275Q9NSD4 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ZNF275Q9NSD4 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ZNF275Q9NSD4 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ZNF275Q9NSD4 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ZNF275Q9NSD4 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ZNF275Q9NSD4 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ZNF275Q9NSD4 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ZNF275Q9NSD4 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ZNF275Q9NSD4 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ZNF275Q9NSD4 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ZNF275Q9NSD4 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
ZNF275Q9NSD4 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ZNF275Q9NSD4 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ZNF275Q9NSD4 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ZNF275Q9NSD4 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ZNF275Q9NSD4 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ZNF275Q9NSD4 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ZNF275Q9NSD4 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ZNF275Q9NSD4 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ZNF275Q9NSD4 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ZNF275Q9NSD4 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ZNF275Q9NSD4 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ZNF275Q9NSD4 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ZNF275Q9NSD4 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ZNF275Q9NSD4 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ZNF275Q9NSD4 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ZNF275Q9NSD4 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ZNF275Q9NSD4 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ZNF275Q9NSD4 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ZNF275Q9NSD4 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ZNF275Q9NSD4 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ZNF275Q9NSD4 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ZNF275Q9NSD4 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ZNF275Q9NSD4 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ZNF275Q9NSD4 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ZNF275Q9NSD4 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ZNF275Q9NSD4 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ZNF275Q9NSD4 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ZNF275Q9NSD4 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ZNF275Q9NSD4 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ZNF275Q9NSD4 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ZNF275Q9NSD4 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
ZNF275Q9NSD4 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ZNF275Q9NSD4 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.9 ms