Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS62

THSD1, Thrombospondin type-1 domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 852 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THSD1Q9NS62 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC26.01■■□□□ 1.75
THSD1Q9NS62 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
THSD1Q9NS62 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
THSD1Q9NS62 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
THSD1Q9NS62 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
THSD1Q9NS62 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
THSD1Q9NS62 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
THSD1Q9NS62 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
THSD1Q9NS62 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
THSD1Q9NS62 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
THSD1Q9NS62 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
THSD1Q9NS62 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
THSD1Q9NS62 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
THSD1Q9NS62 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
THSD1Q9NS62 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
THSD1Q9NS62 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
THSD1Q9NS62 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
THSD1Q9NS62 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
THSD1Q9NS62 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
THSD1Q9NS62 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
THSD1Q9NS62 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
THSD1Q9NS62 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
THSD1Q9NS62 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
THSD1Q9NS62 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
THSD1Q9NS62 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
THSD1Q9NS62 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC25.91■■□□□ 1.74
THSD1Q9NS62 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.91■■□□□ 1.74
THSD1Q9NS62 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
THSD1Q9NS62 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
THSD1Q9NS62 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC25.9■■□□□ 1.74
THSD1Q9NS62 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
THSD1Q9NS62 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
THSD1Q9NS62 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
THSD1Q9NS62 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
THSD1Q9NS62 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
THSD1Q9NS62 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
THSD1Q9NS62 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
THSD1Q9NS62 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
THSD1Q9NS62 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
THSD1Q9NS62 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
THSD1Q9NS62 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
THSD1Q9NS62 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
THSD1Q9NS62 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
THSD1Q9NS62 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
THSD1Q9NS62 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
THSD1Q9NS62 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
THSD1Q9NS62 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
THSD1Q9NS62 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
THSD1Q9NS62 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
THSD1Q9NS62 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
THSD1Q9NS62 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
THSD1Q9NS62 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
THSD1Q9NS62 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
THSD1Q9NS62 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
THSD1Q9NS62 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
THSD1Q9NS62 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
THSD1Q9NS62 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
THSD1Q9NS62 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
THSD1Q9NS62 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
THSD1Q9NS62 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
THSD1Q9NS62 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
THSD1Q9NS62 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
THSD1Q9NS62 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
THSD1Q9NS62 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
THSD1Q9NS62 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
THSD1Q9NS62 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
THSD1Q9NS62 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
THSD1Q9NS62 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
THSD1Q9NS62 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
THSD1Q9NS62 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
THSD1Q9NS62 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
THSD1Q9NS62 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
THSD1Q9NS62 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
THSD1Q9NS62 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
THSD1Q9NS62 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC25.7■■□□□ 1.7
THSD1Q9NS62 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
THSD1Q9NS62 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
THSD1Q9NS62 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
THSD1Q9NS62 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
THSD1Q9NS62 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
THSD1Q9NS62 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
THSD1Q9NS62 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC25.67■■□□□ 1.7
THSD1Q9NS62 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
THSD1Q9NS62 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
THSD1Q9NS62 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
THSD1Q9NS62 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
THSD1Q9NS62 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
THSD1Q9NS62 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
THSD1Q9NS62 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
THSD1Q9NS62 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.7
THSD1Q9NS62 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
THSD1Q9NS62 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC25.64■■□□□ 1.7
THSD1Q9NS62 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
THSD1Q9NS62 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
THSD1Q9NS62 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
THSD1Q9NS62 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
THSD1Q9NS62 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
THSD1Q9NS62 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
THSD1Q9NS62 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC25.62■■□□□ 1.69
THSD1Q9NS62 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms