Protein–RNA interactions for Protein: Q9NR31

SAR1A, GTP-binding protein SAR1a, humanhuman

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAR1AQ9NR31 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
SAR1AQ9NR31 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SAR1AQ9NR31 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SAR1AQ9NR31 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SAR1AQ9NR31 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SAR1AQ9NR31 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SAR1AQ9NR31 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SAR1AQ9NR31 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SAR1AQ9NR31 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SAR1AQ9NR31 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SAR1AQ9NR31 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SAR1AQ9NR31 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SAR1AQ9NR31 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SAR1AQ9NR31 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SAR1AQ9NR31 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SAR1AQ9NR31 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SAR1AQ9NR31 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SAR1AQ9NR31 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SAR1AQ9NR31 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SAR1AQ9NR31 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SAR1AQ9NR31 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SAR1AQ9NR31 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SAR1AQ9NR31 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SAR1AQ9NR31 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SAR1AQ9NR31 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SAR1AQ9NR31 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SAR1AQ9NR31 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SAR1AQ9NR31 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SAR1AQ9NR31 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SAR1AQ9NR31 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SAR1AQ9NR31 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SAR1AQ9NR31 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SAR1AQ9NR31 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SAR1AQ9NR31 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SAR1AQ9NR31 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SAR1AQ9NR31 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SAR1AQ9NR31 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SAR1AQ9NR31 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SAR1AQ9NR31 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SAR1AQ9NR31 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SAR1AQ9NR31 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
SAR1AQ9NR31 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
SAR1AQ9NR31 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SAR1AQ9NR31 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SAR1AQ9NR31 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SAR1AQ9NR31 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SAR1AQ9NR31 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SAR1AQ9NR31 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SAR1AQ9NR31 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SAR1AQ9NR31 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
SAR1AQ9NR31 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SAR1AQ9NR31 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SAR1AQ9NR31 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SAR1AQ9NR31 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SAR1AQ9NR31 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SAR1AQ9NR31 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
SAR1AQ9NR31 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SAR1AQ9NR31 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
SAR1AQ9NR31 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
SAR1AQ9NR31 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SAR1AQ9NR31 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SAR1AQ9NR31 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SAR1AQ9NR31 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SAR1AQ9NR31 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SAR1AQ9NR31 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SAR1AQ9NR31 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SAR1AQ9NR31 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SAR1AQ9NR31 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SAR1AQ9NR31 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SAR1AQ9NR31 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SAR1AQ9NR31 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SAR1AQ9NR31 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SAR1AQ9NR31 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SAR1AQ9NR31 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SAR1AQ9NR31 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SAR1AQ9NR31 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SAR1AQ9NR31 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SAR1AQ9NR31 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SAR1AQ9NR31 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SAR1AQ9NR31 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SAR1AQ9NR31 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SAR1AQ9NR31 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SAR1AQ9NR31 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
SAR1AQ9NR31 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
SAR1AQ9NR31 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SAR1AQ9NR31 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SAR1AQ9NR31 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SAR1AQ9NR31 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SAR1AQ9NR31 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SAR1AQ9NR31 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SAR1AQ9NR31 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SAR1AQ9NR31 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SAR1AQ9NR31 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SAR1AQ9NR31 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SAR1AQ9NR31 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SAR1AQ9NR31 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SAR1AQ9NR31 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SAR1AQ9NR31 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SAR1AQ9NR31 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SAR1AQ9NR31 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51 ms