Protein–RNA interactions for Protein: Q9NR21

PARP11, Poly [ADP-ribose] polymerase 11, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PARP11Q9NR21 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PARP11Q9NR21 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PARP11Q9NR21 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PARP11Q9NR21 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PARP11Q9NR21 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
PARP11Q9NR21 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PARP11Q9NR21 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PARP11Q9NR21 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PARP11Q9NR21 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PARP11Q9NR21 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
PARP11Q9NR21 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PARP11Q9NR21 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PARP11Q9NR21 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PARP11Q9NR21 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PARP11Q9NR21 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PARP11Q9NR21 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PARP11Q9NR21 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PARP11Q9NR21 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PARP11Q9NR21 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PARP11Q9NR21 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
PARP11Q9NR21 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PARP11Q9NR21 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PARP11Q9NR21 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PARP11Q9NR21 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PARP11Q9NR21 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PARP11Q9NR21 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PARP11Q9NR21 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PARP11Q9NR21 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PARP11Q9NR21 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PARP11Q9NR21 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PARP11Q9NR21 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PARP11Q9NR21 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PARP11Q9NR21 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PARP11Q9NR21 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PARP11Q9NR21 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PARP11Q9NR21 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PARP11Q9NR21 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PARP11Q9NR21 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PARP11Q9NR21 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PARP11Q9NR21 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PARP11Q9NR21 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
PARP11Q9NR21 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PARP11Q9NR21 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PARP11Q9NR21 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
PARP11Q9NR21 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PARP11Q9NR21 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
PARP11Q9NR21 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PARP11Q9NR21 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PARP11Q9NR21 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PARP11Q9NR21 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PARP11Q9NR21 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PARP11Q9NR21 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PARP11Q9NR21 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PARP11Q9NR21 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PARP11Q9NR21 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PARP11Q9NR21 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PARP11Q9NR21 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PARP11Q9NR21 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PARP11Q9NR21 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PARP11Q9NR21 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PARP11Q9NR21 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PARP11Q9NR21 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PARP11Q9NR21 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
PARP11Q9NR21 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PARP11Q9NR21 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PARP11Q9NR21 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PARP11Q9NR21 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PARP11Q9NR21 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PARP11Q9NR21 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PARP11Q9NR21 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PARP11Q9NR21 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PARP11Q9NR21 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PARP11Q9NR21 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PARP11Q9NR21 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PARP11Q9NR21 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PARP11Q9NR21 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PARP11Q9NR21 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PARP11Q9NR21 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PARP11Q9NR21 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PARP11Q9NR21 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PARP11Q9NR21 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PARP11Q9NR21 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PARP11Q9NR21 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PARP11Q9NR21 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PARP11Q9NR21 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PARP11Q9NR21 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PARP11Q9NR21 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
PARP11Q9NR21 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PARP11Q9NR21 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PARP11Q9NR21 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PARP11Q9NR21 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PARP11Q9NR21 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PARP11Q9NR21 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PARP11Q9NR21 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
PARP11Q9NR21 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PARP11Q9NR21 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PARP11Q9NR21 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PARP11Q9NR21 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PARP11Q9NR21 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PARP11Q9NR21 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms