Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQX5

NPDC1, Neural proliferation differentiation and control protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPDC1Q9NQX5 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
NPDC1Q9NQX5 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NPDC1Q9NQX5 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NPDC1Q9NQX5 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
NPDC1Q9NQX5 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
NPDC1Q9NQX5 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NPDC1Q9NQX5 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NPDC1Q9NQX5 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NPDC1Q9NQX5 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NPDC1Q9NQX5 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NPDC1Q9NQX5 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NPDC1Q9NQX5 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
NPDC1Q9NQX5 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NPDC1Q9NQX5 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NPDC1Q9NQX5 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NPDC1Q9NQX5 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NPDC1Q9NQX5 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NPDC1Q9NQX5 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NPDC1Q9NQX5 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NPDC1Q9NQX5 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NPDC1Q9NQX5 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NPDC1Q9NQX5 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
NPDC1Q9NQX5 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NPDC1Q9NQX5 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NPDC1Q9NQX5 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NPDC1Q9NQX5 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NPDC1Q9NQX5 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NPDC1Q9NQX5 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NPDC1Q9NQX5 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NPDC1Q9NQX5 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NPDC1Q9NQX5 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NPDC1Q9NQX5 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NPDC1Q9NQX5 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NPDC1Q9NQX5 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NPDC1Q9NQX5 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC23.9■■□□□ 1.42
NPDC1Q9NQX5 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC23.9■■□□□ 1.42
NPDC1Q9NQX5 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NPDC1Q9NQX5 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NPDC1Q9NQX5 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NPDC1Q9NQX5 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
NPDC1Q9NQX5 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
NPDC1Q9NQX5 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
NPDC1Q9NQX5 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NPDC1Q9NQX5 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NPDC1Q9NQX5 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NPDC1Q9NQX5 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NPDC1Q9NQX5 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NPDC1Q9NQX5 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NPDC1Q9NQX5 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NPDC1Q9NQX5 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NPDC1Q9NQX5 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NPDC1Q9NQX5 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NPDC1Q9NQX5 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
NPDC1Q9NQX5 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NPDC1Q9NQX5 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
NPDC1Q9NQX5 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
NPDC1Q9NQX5 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
NPDC1Q9NQX5 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
NPDC1Q9NQX5 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
NPDC1Q9NQX5 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
NPDC1Q9NQX5 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
NPDC1Q9NQX5 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
NPDC1Q9NQX5 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
NPDC1Q9NQX5 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
NPDC1Q9NQX5 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
NPDC1Q9NQX5 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
NPDC1Q9NQX5 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
NPDC1Q9NQX5 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
NPDC1Q9NQX5 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
NPDC1Q9NQX5 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
NPDC1Q9NQX5 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
NPDC1Q9NQX5 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
NPDC1Q9NQX5 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
NPDC1Q9NQX5 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NPDC1Q9NQX5 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NPDC1Q9NQX5 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
NPDC1Q9NQX5 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NPDC1Q9NQX5 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
NPDC1Q9NQX5 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NPDC1Q9NQX5 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NPDC1Q9NQX5 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NPDC1Q9NQX5 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NPDC1Q9NQX5 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NPDC1Q9NQX5 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
NPDC1Q9NQX5 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NPDC1Q9NQX5 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NPDC1Q9NQX5 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NPDC1Q9NQX5 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
NPDC1Q9NQX5 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
NPDC1Q9NQX5 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NPDC1Q9NQX5 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NPDC1Q9NQX5 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
NPDC1Q9NQX5 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NPDC1Q9NQX5 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NPDC1Q9NQX5 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
NPDC1Q9NQX5 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NPDC1Q9NQX5 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NPDC1Q9NQX5 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
NPDC1Q9NQX5 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
NPDC1Q9NQX5 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.8 ms