Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQP4

PFDN4, Prefoldin subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 134 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PFDN4Q9NQP4 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PFDN4Q9NQP4 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PFDN4Q9NQP4 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PFDN4Q9NQP4 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PFDN4Q9NQP4 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PFDN4Q9NQP4 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
PFDN4Q9NQP4 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PFDN4Q9NQP4 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PFDN4Q9NQP4 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PFDN4Q9NQP4 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PFDN4Q9NQP4 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PFDN4Q9NQP4 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PFDN4Q9NQP4 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PFDN4Q9NQP4 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PFDN4Q9NQP4 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PFDN4Q9NQP4 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PFDN4Q9NQP4 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PFDN4Q9NQP4 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PFDN4Q9NQP4 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PFDN4Q9NQP4 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PFDN4Q9NQP4 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PFDN4Q9NQP4 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PFDN4Q9NQP4 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PFDN4Q9NQP4 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PFDN4Q9NQP4 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PFDN4Q9NQP4 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PFDN4Q9NQP4 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PFDN4Q9NQP4 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PFDN4Q9NQP4 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PFDN4Q9NQP4 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PFDN4Q9NQP4 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PFDN4Q9NQP4 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PFDN4Q9NQP4 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PFDN4Q9NQP4 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PFDN4Q9NQP4 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PFDN4Q9NQP4 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PFDN4Q9NQP4 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PFDN4Q9NQP4 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PFDN4Q9NQP4 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PFDN4Q9NQP4 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PFDN4Q9NQP4 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PFDN4Q9NQP4 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PFDN4Q9NQP4 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PFDN4Q9NQP4 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PFDN4Q9NQP4 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PFDN4Q9NQP4 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PFDN4Q9NQP4 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PFDN4Q9NQP4 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
PFDN4Q9NQP4 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PFDN4Q9NQP4 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PFDN4Q9NQP4 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PFDN4Q9NQP4 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PFDN4Q9NQP4 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PFDN4Q9NQP4 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PFDN4Q9NQP4 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PFDN4Q9NQP4 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PFDN4Q9NQP4 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PFDN4Q9NQP4 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PFDN4Q9NQP4 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PFDN4Q9NQP4 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PFDN4Q9NQP4 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PFDN4Q9NQP4 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PFDN4Q9NQP4 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PFDN4Q9NQP4 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PFDN4Q9NQP4 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PFDN4Q9NQP4 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PFDN4Q9NQP4 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
PFDN4Q9NQP4 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PFDN4Q9NQP4 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PFDN4Q9NQP4 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PFDN4Q9NQP4 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PFDN4Q9NQP4 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PFDN4Q9NQP4 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PFDN4Q9NQP4 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PFDN4Q9NQP4 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PFDN4Q9NQP4 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PFDN4Q9NQP4 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PFDN4Q9NQP4 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PFDN4Q9NQP4 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.7
PFDN4Q9NQP4 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PFDN4Q9NQP4 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PFDN4Q9NQP4 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PFDN4Q9NQP4 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
PFDN4Q9NQP4 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PFDN4Q9NQP4 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
PFDN4Q9NQP4 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
PFDN4Q9NQP4 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PFDN4Q9NQP4 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PFDN4Q9NQP4 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PFDN4Q9NQP4 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PFDN4Q9NQP4 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PFDN4Q9NQP4 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PFDN4Q9NQP4 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PFDN4Q9NQP4 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PFDN4Q9NQP4 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PFDN4Q9NQP4 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PFDN4Q9NQP4 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PFDN4Q9NQP4 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PFDN4Q9NQP4 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PFDN4Q9NQP4 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.9 ms