Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPI1

BRD7, Bromodomain-containing protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 651 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRD7Q9NPI1 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
BRD7Q9NPI1 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
BRD7Q9NPI1 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
BRD7Q9NPI1 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
BRD7Q9NPI1 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
BRD7Q9NPI1 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
BRD7Q9NPI1 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
BRD7Q9NPI1 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
BRD7Q9NPI1 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
BRD7Q9NPI1 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
BRD7Q9NPI1 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
BRD7Q9NPI1 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
BRD7Q9NPI1 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
BRD7Q9NPI1 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
BRD7Q9NPI1 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
BRD7Q9NPI1 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
BRD7Q9NPI1 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
BRD7Q9NPI1 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
BRD7Q9NPI1 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
BRD7Q9NPI1 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
BRD7Q9NPI1 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
BRD7Q9NPI1 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
BRD7Q9NPI1 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
BRD7Q9NPI1 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
BRD7Q9NPI1 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
BRD7Q9NPI1 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
BRD7Q9NPI1 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
BRD7Q9NPI1 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
BRD7Q9NPI1 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
BRD7Q9NPI1 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
BRD7Q9NPI1 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
BRD7Q9NPI1 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
BRD7Q9NPI1 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
BRD7Q9NPI1 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
BRD7Q9NPI1 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
BRD7Q9NPI1 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
BRD7Q9NPI1 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
BRD7Q9NPI1 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
BRD7Q9NPI1 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
BRD7Q9NPI1 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
BRD7Q9NPI1 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
BRD7Q9NPI1 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
BRD7Q9NPI1 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
BRD7Q9NPI1 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
BRD7Q9NPI1 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
BRD7Q9NPI1 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
BRD7Q9NPI1 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
BRD7Q9NPI1 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
BRD7Q9NPI1 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
BRD7Q9NPI1 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
BRD7Q9NPI1 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
BRD7Q9NPI1 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
BRD7Q9NPI1 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
BRD7Q9NPI1 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
BRD7Q9NPI1 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
BRD7Q9NPI1 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
BRD7Q9NPI1 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
BRD7Q9NPI1 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
BRD7Q9NPI1 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
BRD7Q9NPI1 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
BRD7Q9NPI1 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
BRD7Q9NPI1 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
BRD7Q9NPI1 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
BRD7Q9NPI1 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
BRD7Q9NPI1 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
BRD7Q9NPI1 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
BRD7Q9NPI1 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
BRD7Q9NPI1 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
BRD7Q9NPI1 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
BRD7Q9NPI1 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
BRD7Q9NPI1 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
BRD7Q9NPI1 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
BRD7Q9NPI1 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
BRD7Q9NPI1 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
BRD7Q9NPI1 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
BRD7Q9NPI1 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
BRD7Q9NPI1 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
BRD7Q9NPI1 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
BRD7Q9NPI1 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
BRD7Q9NPI1 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
BRD7Q9NPI1 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
BRD7Q9NPI1 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
BRD7Q9NPI1 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
BRD7Q9NPI1 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
BRD7Q9NPI1 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
BRD7Q9NPI1 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
BRD7Q9NPI1 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
BRD7Q9NPI1 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
BRD7Q9NPI1 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
BRD7Q9NPI1 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
BRD7Q9NPI1 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
BRD7Q9NPI1 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
BRD7Q9NPI1 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
BRD7Q9NPI1 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
BRD7Q9NPI1 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
BRD7Q9NPI1 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
BRD7Q9NPI1 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
BRD7Q9NPI1 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
BRD7Q9NPI1 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
BRD7Q9NPI1 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.7 ms