Protein–RNA interactions for Protein: Q9H9Z2

LIN28A, Protein lin-28 homolog A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIN28AQ9H9Z2 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
LIN28AQ9H9Z2 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
LIN28AQ9H9Z2 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
LIN28AQ9H9Z2 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
LIN28AQ9H9Z2 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
LIN28AQ9H9Z2 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
LIN28AQ9H9Z2 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
LIN28AQ9H9Z2 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
LIN28AQ9H9Z2 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
LIN28AQ9H9Z2 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
LIN28AQ9H9Z2 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
LIN28AQ9H9Z2 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
LIN28AQ9H9Z2 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
LIN28AQ9H9Z2 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
LIN28AQ9H9Z2 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
LIN28AQ9H9Z2 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
LIN28AQ9H9Z2 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
LIN28AQ9H9Z2 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
LIN28AQ9H9Z2 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
LIN28AQ9H9Z2 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
LIN28AQ9H9Z2 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
LIN28AQ9H9Z2 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
LIN28AQ9H9Z2 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
LIN28AQ9H9Z2 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
LIN28AQ9H9Z2 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
LIN28AQ9H9Z2 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
LIN28AQ9H9Z2 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
LIN28AQ9H9Z2 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
LIN28AQ9H9Z2 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
LIN28AQ9H9Z2 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
LIN28AQ9H9Z2 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
LIN28AQ9H9Z2 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
LIN28AQ9H9Z2 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
LIN28AQ9H9Z2 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
LIN28AQ9H9Z2 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
LIN28AQ9H9Z2 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
LIN28AQ9H9Z2 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
LIN28AQ9H9Z2 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
LIN28AQ9H9Z2 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
LIN28AQ9H9Z2 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
LIN28AQ9H9Z2 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
LIN28AQ9H9Z2 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
LIN28AQ9H9Z2 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
LIN28AQ9H9Z2 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
LIN28AQ9H9Z2 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
LIN28AQ9H9Z2 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
LIN28AQ9H9Z2 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
LIN28AQ9H9Z2 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
LIN28AQ9H9Z2 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
LIN28AQ9H9Z2 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
LIN28AQ9H9Z2 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
LIN28AQ9H9Z2 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
LIN28AQ9H9Z2 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
LIN28AQ9H9Z2 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
LIN28AQ9H9Z2 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
LIN28AQ9H9Z2 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
LIN28AQ9H9Z2 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
LIN28AQ9H9Z2 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
LIN28AQ9H9Z2 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
LIN28AQ9H9Z2 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
LIN28AQ9H9Z2 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
LIN28AQ9H9Z2 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
LIN28AQ9H9Z2 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
LIN28AQ9H9Z2 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
LIN28AQ9H9Z2 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
LIN28AQ9H9Z2 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
LIN28AQ9H9Z2 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
LIN28AQ9H9Z2 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
LIN28AQ9H9Z2 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
LIN28AQ9H9Z2 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
LIN28AQ9H9Z2 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
LIN28AQ9H9Z2 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
LIN28AQ9H9Z2 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
LIN28AQ9H9Z2 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
LIN28AQ9H9Z2 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
LIN28AQ9H9Z2 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
LIN28AQ9H9Z2 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
LIN28AQ9H9Z2 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
LIN28AQ9H9Z2 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
LIN28AQ9H9Z2 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
LIN28AQ9H9Z2 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
LIN28AQ9H9Z2 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC25■■□□□ 1.59
LIN28AQ9H9Z2 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC25■■□□□ 1.59
LIN28AQ9H9Z2 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
LIN28AQ9H9Z2 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
LIN28AQ9H9Z2 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
LIN28AQ9H9Z2 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
LIN28AQ9H9Z2 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
LIN28AQ9H9Z2 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
LIN28AQ9H9Z2 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
LIN28AQ9H9Z2 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC24.97■■□□□ 1.59
LIN28AQ9H9Z2 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
LIN28AQ9H9Z2 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
LIN28AQ9H9Z2 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
LIN28AQ9H9Z2 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
LIN28AQ9H9Z2 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
LIN28AQ9H9Z2 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
LIN28AQ9H9Z2 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
LIN28AQ9H9Z2 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
LIN28AQ9H9Z2 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms