Protein–RNA interactions for Protein: Q9H8W3

FAM204A, Protein FAM204A, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM204AQ9H8W3 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
FAM204AQ9H8W3 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
FAM204AQ9H8W3 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
FAM204AQ9H8W3 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
FAM204AQ9H8W3 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
FAM204AQ9H8W3 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
FAM204AQ9H8W3 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
FAM204AQ9H8W3 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
FAM204AQ9H8W3 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.13
FAM204AQ9H8W3 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
FAM204AQ9H8W3 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
FAM204AQ9H8W3 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
FAM204AQ9H8W3 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
FAM204AQ9H8W3 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
FAM204AQ9H8W3 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
FAM204AQ9H8W3 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
FAM204AQ9H8W3 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
FAM204AQ9H8W3 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
FAM204AQ9H8W3 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
FAM204AQ9H8W3 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
FAM204AQ9H8W3 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
FAM204AQ9H8W3 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
FAM204AQ9H8W3 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
FAM204AQ9H8W3 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
FAM204AQ9H8W3 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
FAM204AQ9H8W3 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
FAM204AQ9H8W3 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
FAM204AQ9H8W3 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
FAM204AQ9H8W3 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
FAM204AQ9H8W3 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
FAM204AQ9H8W3 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
FAM204AQ9H8W3 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
FAM204AQ9H8W3 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
FAM204AQ9H8W3 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
FAM204AQ9H8W3 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
FAM204AQ9H8W3 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
FAM204AQ9H8W3 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
FAM204AQ9H8W3 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
FAM204AQ9H8W3 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
FAM204AQ9H8W3 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
FAM204AQ9H8W3 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
FAM204AQ9H8W3 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
FAM204AQ9H8W3 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
FAM204AQ9H8W3 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
FAM204AQ9H8W3 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
FAM204AQ9H8W3 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
FAM204AQ9H8W3 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
FAM204AQ9H8W3 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
FAM204AQ9H8W3 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
FAM204AQ9H8W3 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
FAM204AQ9H8W3 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
FAM204AQ9H8W3 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
FAM204AQ9H8W3 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
FAM204AQ9H8W3 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
FAM204AQ9H8W3 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
FAM204AQ9H8W3 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
FAM204AQ9H8W3 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
FAM204AQ9H8W3 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
FAM204AQ9H8W3 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
FAM204AQ9H8W3 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
FAM204AQ9H8W3 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
FAM204AQ9H8W3 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
FAM204AQ9H8W3 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
FAM204AQ9H8W3 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
FAM204AQ9H8W3 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
FAM204AQ9H8W3 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
FAM204AQ9H8W3 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
FAM204AQ9H8W3 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
FAM204AQ9H8W3 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
FAM204AQ9H8W3 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
FAM204AQ9H8W3 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
FAM204AQ9H8W3 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
FAM204AQ9H8W3 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
FAM204AQ9H8W3 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
FAM204AQ9H8W3 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
FAM204AQ9H8W3 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
FAM204AQ9H8W3 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
FAM204AQ9H8W3 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
FAM204AQ9H8W3 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
FAM204AQ9H8W3 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
FAM204AQ9H8W3 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
FAM204AQ9H8W3 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
FAM204AQ9H8W3 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
FAM204AQ9H8W3 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
FAM204AQ9H8W3 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
FAM204AQ9H8W3 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
FAM204AQ9H8W3 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
FAM204AQ9H8W3 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
FAM204AQ9H8W3 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
FAM204AQ9H8W3 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
FAM204AQ9H8W3 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
FAM204AQ9H8W3 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
FAM204AQ9H8W3 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
FAM204AQ9H8W3 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
FAM204AQ9H8W3 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
FAM204AQ9H8W3 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
FAM204AQ9H8W3 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
FAM204AQ9H8W3 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
FAM204AQ9H8W3 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
FAM204AQ9H8W3 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.3 ms