Protein–RNA interactions for Protein: Q9H841

NIPAL2, NIPA-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPAL2Q9H841 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NIPAL2Q9H841 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NIPAL2Q9H841 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NIPAL2Q9H841 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NIPAL2Q9H841 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NIPAL2Q9H841 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NIPAL2Q9H841 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NIPAL2Q9H841 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NIPAL2Q9H841 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NIPAL2Q9H841 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NIPAL2Q9H841 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NIPAL2Q9H841 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NIPAL2Q9H841 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NIPAL2Q9H841 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NIPAL2Q9H841 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NIPAL2Q9H841 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NIPAL2Q9H841 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NIPAL2Q9H841 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
NIPAL2Q9H841 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NIPAL2Q9H841 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NIPAL2Q9H841 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NIPAL2Q9H841 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NIPAL2Q9H841 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NIPAL2Q9H841 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NIPAL2Q9H841 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NIPAL2Q9H841 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NIPAL2Q9H841 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NIPAL2Q9H841 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NIPAL2Q9H841 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NIPAL2Q9H841 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NIPAL2Q9H841 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NIPAL2Q9H841 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NIPAL2Q9H841 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NIPAL2Q9H841 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NIPAL2Q9H841 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NIPAL2Q9H841 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NIPAL2Q9H841 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NIPAL2Q9H841 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NIPAL2Q9H841 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NIPAL2Q9H841 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NIPAL2Q9H841 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NIPAL2Q9H841 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NIPAL2Q9H841 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NIPAL2Q9H841 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NIPAL2Q9H841 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NIPAL2Q9H841 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NIPAL2Q9H841 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
NIPAL2Q9H841 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NIPAL2Q9H841 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NIPAL2Q9H841 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NIPAL2Q9H841 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NIPAL2Q9H841 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NIPAL2Q9H841 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NIPAL2Q9H841 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
NIPAL2Q9H841 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
NIPAL2Q9H841 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NIPAL2Q9H841 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NIPAL2Q9H841 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NIPAL2Q9H841 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
NIPAL2Q9H841 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NIPAL2Q9H841 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NIPAL2Q9H841 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NIPAL2Q9H841 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NIPAL2Q9H841 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NIPAL2Q9H841 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NIPAL2Q9H841 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NIPAL2Q9H841 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NIPAL2Q9H841 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NIPAL2Q9H841 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NIPAL2Q9H841 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NIPAL2Q9H841 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NIPAL2Q9H841 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NIPAL2Q9H841 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
NIPAL2Q9H841 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NIPAL2Q9H841 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NIPAL2Q9H841 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NIPAL2Q9H841 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NIPAL2Q9H841 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NIPAL2Q9H841 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NIPAL2Q9H841 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NIPAL2Q9H841 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NIPAL2Q9H841 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NIPAL2Q9H841 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NIPAL2Q9H841 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NIPAL2Q9H841 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NIPAL2Q9H841 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NIPAL2Q9H841 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NIPAL2Q9H841 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NIPAL2Q9H841 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NIPAL2Q9H841 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NIPAL2Q9H841 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NIPAL2Q9H841 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NIPAL2Q9H841 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NIPAL2Q9H841 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NIPAL2Q9H841 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NIPAL2Q9H841 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NIPAL2Q9H841 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NIPAL2Q9H841 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NIPAL2Q9H841 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NIPAL2Q9H841 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.5 ms