Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6Y7

RNF167, E3 ubiquitin-protein ligase RNF167, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF167Q9H6Y7 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RNF167Q9H6Y7 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
RNF167Q9H6Y7 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RNF167Q9H6Y7 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
RNF167Q9H6Y7 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RNF167Q9H6Y7 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RNF167Q9H6Y7 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
RNF167Q9H6Y7 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RNF167Q9H6Y7 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
RNF167Q9H6Y7 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
RNF167Q9H6Y7 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
RNF167Q9H6Y7 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
RNF167Q9H6Y7 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RNF167Q9H6Y7 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
RNF167Q9H6Y7 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RNF167Q9H6Y7 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
RNF167Q9H6Y7 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
RNF167Q9H6Y7 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
RNF167Q9H6Y7 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
RNF167Q9H6Y7 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
RNF167Q9H6Y7 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RNF167Q9H6Y7 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RNF167Q9H6Y7 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RNF167Q9H6Y7 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RNF167Q9H6Y7 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RNF167Q9H6Y7 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RNF167Q9H6Y7 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RNF167Q9H6Y7 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RNF167Q9H6Y7 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RNF167Q9H6Y7 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RNF167Q9H6Y7 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RNF167Q9H6Y7 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RNF167Q9H6Y7 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RNF167Q9H6Y7 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RNF167Q9H6Y7 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RNF167Q9H6Y7 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RNF167Q9H6Y7 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RNF167Q9H6Y7 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RNF167Q9H6Y7 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RNF167Q9H6Y7 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
RNF167Q9H6Y7 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RNF167Q9H6Y7 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RNF167Q9H6Y7 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
RNF167Q9H6Y7 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RNF167Q9H6Y7 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RNF167Q9H6Y7 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RNF167Q9H6Y7 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RNF167Q9H6Y7 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RNF167Q9H6Y7 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RNF167Q9H6Y7 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RNF167Q9H6Y7 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RNF167Q9H6Y7 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RNF167Q9H6Y7 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RNF167Q9H6Y7 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RNF167Q9H6Y7 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RNF167Q9H6Y7 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RNF167Q9H6Y7 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
RNF167Q9H6Y7 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RNF167Q9H6Y7 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RNF167Q9H6Y7 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RNF167Q9H6Y7 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RNF167Q9H6Y7 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RNF167Q9H6Y7 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RNF167Q9H6Y7 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RNF167Q9H6Y7 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RNF167Q9H6Y7 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RNF167Q9H6Y7 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RNF167Q9H6Y7 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RNF167Q9H6Y7 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
RNF167Q9H6Y7 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RNF167Q9H6Y7 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RNF167Q9H6Y7 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RNF167Q9H6Y7 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RNF167Q9H6Y7 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RNF167Q9H6Y7 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RNF167Q9H6Y7 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RNF167Q9H6Y7 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RNF167Q9H6Y7 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RNF167Q9H6Y7 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RNF167Q9H6Y7 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RNF167Q9H6Y7 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RNF167Q9H6Y7 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RNF167Q9H6Y7 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RNF167Q9H6Y7 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RNF167Q9H6Y7 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RNF167Q9H6Y7 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RNF167Q9H6Y7 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RNF167Q9H6Y7 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RNF167Q9H6Y7 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RNF167Q9H6Y7 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RNF167Q9H6Y7 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RNF167Q9H6Y7 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RNF167Q9H6Y7 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RNF167Q9H6Y7 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RNF167Q9H6Y7 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
RNF167Q9H6Y7 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
RNF167Q9H6Y7 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RNF167Q9H6Y7 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RNF167Q9H6Y7 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RNF167Q9H6Y7 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.2 ms