Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6A0

DENND2D, DENN domain-containing protein 2D, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 471 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DENND2DQ9H6A0 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
DENND2DQ9H6A0 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
DENND2DQ9H6A0 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
DENND2DQ9H6A0 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
DENND2DQ9H6A0 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
DENND2DQ9H6A0 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
DENND2DQ9H6A0 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
DENND2DQ9H6A0 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
DENND2DQ9H6A0 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
DENND2DQ9H6A0 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
DENND2DQ9H6A0 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
DENND2DQ9H6A0 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
DENND2DQ9H6A0 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
DENND2DQ9H6A0 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
DENND2DQ9H6A0 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
DENND2DQ9H6A0 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
DENND2DQ9H6A0 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
DENND2DQ9H6A0 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
DENND2DQ9H6A0 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
DENND2DQ9H6A0 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
DENND2DQ9H6A0 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
DENND2DQ9H6A0 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
DENND2DQ9H6A0 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
DENND2DQ9H6A0 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
DENND2DQ9H6A0 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
DENND2DQ9H6A0 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
DENND2DQ9H6A0 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
DENND2DQ9H6A0 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
DENND2DQ9H6A0 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
DENND2DQ9H6A0 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
DENND2DQ9H6A0 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
DENND2DQ9H6A0 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
DENND2DQ9H6A0 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
DENND2DQ9H6A0 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
DENND2DQ9H6A0 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
DENND2DQ9H6A0 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
DENND2DQ9H6A0 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
DENND2DQ9H6A0 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
DENND2DQ9H6A0 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
DENND2DQ9H6A0 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
DENND2DQ9H6A0 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
DENND2DQ9H6A0 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
DENND2DQ9H6A0 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
DENND2DQ9H6A0 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
DENND2DQ9H6A0 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
DENND2DQ9H6A0 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
DENND2DQ9H6A0 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
DENND2DQ9H6A0 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
DENND2DQ9H6A0 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
DENND2DQ9H6A0 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
DENND2DQ9H6A0 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
DENND2DQ9H6A0 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
DENND2DQ9H6A0 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
DENND2DQ9H6A0 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
DENND2DQ9H6A0 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
DENND2DQ9H6A0 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
DENND2DQ9H6A0 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
DENND2DQ9H6A0 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
DENND2DQ9H6A0 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
DENND2DQ9H6A0 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
DENND2DQ9H6A0 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
DENND2DQ9H6A0 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
DENND2DQ9H6A0 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
DENND2DQ9H6A0 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
DENND2DQ9H6A0 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
DENND2DQ9H6A0 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
DENND2DQ9H6A0 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
DENND2DQ9H6A0 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
DENND2DQ9H6A0 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
DENND2DQ9H6A0 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
DENND2DQ9H6A0 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
DENND2DQ9H6A0 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
DENND2DQ9H6A0 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
DENND2DQ9H6A0 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
DENND2DQ9H6A0 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
DENND2DQ9H6A0 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
DENND2DQ9H6A0 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
DENND2DQ9H6A0 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
DENND2DQ9H6A0 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
DENND2DQ9H6A0 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
DENND2DQ9H6A0 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
DENND2DQ9H6A0 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
DENND2DQ9H6A0 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
DENND2DQ9H6A0 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
DENND2DQ9H6A0 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
DENND2DQ9H6A0 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
DENND2DQ9H6A0 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
DENND2DQ9H6A0 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
DENND2DQ9H6A0 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
DENND2DQ9H6A0 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
DENND2DQ9H6A0 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
DENND2DQ9H6A0 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
DENND2DQ9H6A0 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
DENND2DQ9H6A0 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
DENND2DQ9H6A0 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
DENND2DQ9H6A0 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
DENND2DQ9H6A0 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
DENND2DQ9H6A0 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
DENND2DQ9H6A0 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
DENND2DQ9H6A0 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.8 ms