Protein–RNA interactions for Protein: Q9H5N1

RABEP2, Rab GTPase-binding effector protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 569 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABEP2Q9H5N1 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
RABEP2Q9H5N1 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
RABEP2Q9H5N1 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
RABEP2Q9H5N1 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
RABEP2Q9H5N1 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
RABEP2Q9H5N1 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
RABEP2Q9H5N1 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
RABEP2Q9H5N1 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
RABEP2Q9H5N1 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
RABEP2Q9H5N1 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC27.06■■□□□ 1.92
RABEP2Q9H5N1 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
RABEP2Q9H5N1 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
RABEP2Q9H5N1 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
RABEP2Q9H5N1 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
RABEP2Q9H5N1 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC27.03■■□□□ 1.92
RABEP2Q9H5N1 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
RABEP2Q9H5N1 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
RABEP2Q9H5N1 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
RABEP2Q9H5N1 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
RABEP2Q9H5N1 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
RABEP2Q9H5N1 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
RABEP2Q9H5N1 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
RABEP2Q9H5N1 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
RABEP2Q9H5N1 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
RABEP2Q9H5N1 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
RABEP2Q9H5N1 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
RABEP2Q9H5N1 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
RABEP2Q9H5N1 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
RABEP2Q9H5N1 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
RABEP2Q9H5N1 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
RABEP2Q9H5N1 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
RABEP2Q9H5N1 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
RABEP2Q9H5N1 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
RABEP2Q9H5N1 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
RABEP2Q9H5N1 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
RABEP2Q9H5N1 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
RABEP2Q9H5N1 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
RABEP2Q9H5N1 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
RABEP2Q9H5N1 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
RABEP2Q9H5N1 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
RABEP2Q9H5N1 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
RABEP2Q9H5N1 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
RABEP2Q9H5N1 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
RABEP2Q9H5N1 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
RABEP2Q9H5N1 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
RABEP2Q9H5N1 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
RABEP2Q9H5N1 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
RABEP2Q9H5N1 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
RABEP2Q9H5N1 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
RABEP2Q9H5N1 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
RABEP2Q9H5N1 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
RABEP2Q9H5N1 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
RABEP2Q9H5N1 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
RABEP2Q9H5N1 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
RABEP2Q9H5N1 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
RABEP2Q9H5N1 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
RABEP2Q9H5N1 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
RABEP2Q9H5N1 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
RABEP2Q9H5N1 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
RABEP2Q9H5N1 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
RABEP2Q9H5N1 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
RABEP2Q9H5N1 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
RABEP2Q9H5N1 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
RABEP2Q9H5N1 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
RABEP2Q9H5N1 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
RABEP2Q9H5N1 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
RABEP2Q9H5N1 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
RABEP2Q9H5N1 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
RABEP2Q9H5N1 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
RABEP2Q9H5N1 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
RABEP2Q9H5N1 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
RABEP2Q9H5N1 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
RABEP2Q9H5N1 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
RABEP2Q9H5N1 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
RABEP2Q9H5N1 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
RABEP2Q9H5N1 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
RABEP2Q9H5N1 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
RABEP2Q9H5N1 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
RABEP2Q9H5N1 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
RABEP2Q9H5N1 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
RABEP2Q9H5N1 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
RABEP2Q9H5N1 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
RABEP2Q9H5N1 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
RABEP2Q9H5N1 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
RABEP2Q9H5N1 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
RABEP2Q9H5N1 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
RABEP2Q9H5N1 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
RABEP2Q9H5N1 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
RABEP2Q9H5N1 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
RABEP2Q9H5N1 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
RABEP2Q9H5N1 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
RABEP2Q9H5N1 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
RABEP2Q9H5N1 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
RABEP2Q9H5N1 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
RABEP2Q9H5N1 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
RABEP2Q9H5N1 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
RABEP2Q9H5N1 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
RABEP2Q9H5N1 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
RABEP2Q9H5N1 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
RABEP2Q9H5N1 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.1 ms