Protein–RNA interactions for Protein: Q9H444

CHMP4B, Charged multivesicular body protein 4b, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMP4BQ9H444 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC33.61■■■□□ 2.97
CHMP4BQ9H444 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.61■■■□□ 2.97
CHMP4BQ9H444 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC33.6■■■□□ 2.97
CHMP4BQ9H444 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
CHMP4BQ9H444 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC33.6■■■□□ 2.97
CHMP4BQ9H444 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
CHMP4BQ9H444 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC33.59■■■□□ 2.97
CHMP4BQ9H444 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC33.59■■■□□ 2.97
CHMP4BQ9H444 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
CHMP4BQ9H444 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
CHMP4BQ9H444 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC33.58■■■□□ 2.97
CHMP4BQ9H444 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC33.58■■■□□ 2.97
CHMP4BQ9H444 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
CHMP4BQ9H444 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC33.56■■■□□ 2.96
CHMP4BQ9H444 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
CHMP4BQ9H444 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
CHMP4BQ9H444 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
CHMP4BQ9H444 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
CHMP4BQ9H444 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC33.53■■■□□ 2.96
CHMP4BQ9H444 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
CHMP4BQ9H444 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
CHMP4BQ9H444 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC33.52■■■□□ 2.96
CHMP4BQ9H444 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
CHMP4BQ9H444 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
CHMP4BQ9H444 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
CHMP4BQ9H444 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
CHMP4BQ9H444 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC33.5■■■□□ 2.95
CHMP4BQ9H444 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC33.49■■■□□ 2.95
CHMP4BQ9H444 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
CHMP4BQ9H444 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.49■■■□□ 2.95
CHMP4BQ9H444 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC33.49■■■□□ 2.95
CHMP4BQ9H444 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
CHMP4BQ9H444 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
CHMP4BQ9H444 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
CHMP4BQ9H444 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
CHMP4BQ9H444 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.47■■■□□ 2.95
CHMP4BQ9H444 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
CHMP4BQ9H444 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
CHMP4BQ9H444 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.46■■■□□ 2.95
CHMP4BQ9H444 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
CHMP4BQ9H444 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
CHMP4BQ9H444 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
CHMP4BQ9H444 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC33.43■■■□□ 2.94
CHMP4BQ9H444 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.43■■■□□ 2.94
CHMP4BQ9H444 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
CHMP4BQ9H444 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
CHMP4BQ9H444 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
CHMP4BQ9H444 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.41■■■□□ 2.94
CHMP4BQ9H444 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
CHMP4BQ9H444 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC33.4■■■□□ 2.94
CHMP4BQ9H444 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
CHMP4BQ9H444 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.39■■■□□ 2.94
CHMP4BQ9H444 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC33.39■■■□□ 2.94
CHMP4BQ9H444 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.38■■■□□ 2.93
CHMP4BQ9H444 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC33.37■■■□□ 2.93
CHMP4BQ9H444 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.37■■■□□ 2.93
CHMP4BQ9H444 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
CHMP4BQ9H444 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC33.36■■■□□ 2.93
CHMP4BQ9H444 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
CHMP4BQ9H444 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC33.35■■■□□ 2.93
CHMP4BQ9H444 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
CHMP4BQ9H444 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
CHMP4BQ9H444 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
CHMP4BQ9H444 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.93
CHMP4BQ9H444 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
CHMP4BQ9H444 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.32■■■□□ 2.92
CHMP4BQ9H444 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
CHMP4BQ9H444 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC33.31■■■□□ 2.92
CHMP4BQ9H444 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.31■■■□□ 2.92
CHMP4BQ9H444 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC33.3■■■□□ 2.92
CHMP4BQ9H444 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
CHMP4BQ9H444 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
CHMP4BQ9H444 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
CHMP4BQ9H444 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
CHMP4BQ9H444 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
CHMP4BQ9H444 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC33.28■■■□□ 2.92
CHMP4BQ9H444 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC33.28■■■□□ 2.92
CHMP4BQ9H444 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
CHMP4BQ9H444 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
CHMP4BQ9H444 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC33.27■■■□□ 2.92
CHMP4BQ9H444 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.92
CHMP4BQ9H444 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC33.26■■■□□ 2.92
CHMP4BQ9H444 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
CHMP4BQ9H444 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
CHMP4BQ9H444 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
CHMP4BQ9H444 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.23■■■□□ 2.91
CHMP4BQ9H444 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
CHMP4BQ9H444 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC33.23■■■□□ 2.91
CHMP4BQ9H444 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC33.23■■■□□ 2.91
CHMP4BQ9H444 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.21■■■□□ 2.91
CHMP4BQ9H444 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
CHMP4BQ9H444 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
CHMP4BQ9H444 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
CHMP4BQ9H444 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
CHMP4BQ9H444 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
CHMP4BQ9H444 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
CHMP4BQ9H444 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
CHMP4BQ9H444 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
CHMP4BQ9H444 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC33.17■■■□□ 2.9
CHMP4BQ9H444 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC33.17■■■□□ 2.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.3 ms