Protein–RNA interactions for Protein: Q9H3S1

SEMA4A, Semaphorin-4A, humanhuman

Predictions only

Length 761 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4AQ9H3S1 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
SEMA4AQ9H3S1 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
SEMA4AQ9H3S1 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
SEMA4AQ9H3S1 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
SEMA4AQ9H3S1 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC28.27■■■□□ 2.12
SEMA4AQ9H3S1 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
SEMA4AQ9H3S1 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
SEMA4AQ9H3S1 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
SEMA4AQ9H3S1 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
SEMA4AQ9H3S1 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
SEMA4AQ9H3S1 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
SEMA4AQ9H3S1 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
SEMA4AQ9H3S1 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
SEMA4AQ9H3S1 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
SEMA4AQ9H3S1 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
SEMA4AQ9H3S1 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
SEMA4AQ9H3S1 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
SEMA4AQ9H3S1 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
SEMA4AQ9H3S1 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
SEMA4AQ9H3S1 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
SEMA4AQ9H3S1 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
SEMA4AQ9H3S1 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
SEMA4AQ9H3S1 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
SEMA4AQ9H3S1 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SEMA4AQ9H3S1 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
SEMA4AQ9H3S1 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
SEMA4AQ9H3S1 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
SEMA4AQ9H3S1 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
SEMA4AQ9H3S1 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
SEMA4AQ9H3S1 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
SEMA4AQ9H3S1 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
SEMA4AQ9H3S1 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
SEMA4AQ9H3S1 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
SEMA4AQ9H3S1 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
SEMA4AQ9H3S1 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.13■■■□□ 2.09
SEMA4AQ9H3S1 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
SEMA4AQ9H3S1 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SEMA4AQ9H3S1 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
SEMA4AQ9H3S1 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
SEMA4AQ9H3S1 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
SEMA4AQ9H3S1 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
SEMA4AQ9H3S1 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
SEMA4AQ9H3S1 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SEMA4AQ9H3S1 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SEMA4AQ9H3S1 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SEMA4AQ9H3S1 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
SEMA4AQ9H3S1 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SEMA4AQ9H3S1 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SEMA4AQ9H3S1 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
SEMA4AQ9H3S1 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
SEMA4AQ9H3S1 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SEMA4AQ9H3S1 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SEMA4AQ9H3S1 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SEMA4AQ9H3S1 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SEMA4AQ9H3S1 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
SEMA4AQ9H3S1 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SEMA4AQ9H3S1 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SEMA4AQ9H3S1 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
SEMA4AQ9H3S1 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SEMA4AQ9H3S1 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SEMA4AQ9H3S1 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SEMA4AQ9H3S1 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
SEMA4AQ9H3S1 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
SEMA4AQ9H3S1 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
SEMA4AQ9H3S1 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
SEMA4AQ9H3S1 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
SEMA4AQ9H3S1 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SEMA4AQ9H3S1 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SEMA4AQ9H3S1 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
SEMA4AQ9H3S1 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SEMA4AQ9H3S1 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC27.99■■■□□ 2.07
SEMA4AQ9H3S1 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SEMA4AQ9H3S1 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
SEMA4AQ9H3S1 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
SEMA4AQ9H3S1 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SEMA4AQ9H3S1 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
SEMA4AQ9H3S1 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
SEMA4AQ9H3S1 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
SEMA4AQ9H3S1 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
SEMA4AQ9H3S1 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
SEMA4AQ9H3S1 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
SEMA4AQ9H3S1 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
SEMA4AQ9H3S1 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
SEMA4AQ9H3S1 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
SEMA4AQ9H3S1 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
SEMA4AQ9H3S1 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
SEMA4AQ9H3S1 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
SEMA4AQ9H3S1 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
SEMA4AQ9H3S1 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
SEMA4AQ9H3S1 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
SEMA4AQ9H3S1 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
SEMA4AQ9H3S1 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
SEMA4AQ9H3S1 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
SEMA4AQ9H3S1 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
SEMA4AQ9H3S1 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
SEMA4AQ9H3S1 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SEMA4AQ9H3S1 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SEMA4AQ9H3S1 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SEMA4AQ9H3S1 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SEMA4AQ9H3S1 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.9 ms