Protein–RNA interactions for Protein: Q9H211

CDT1, DNA replication factor Cdt1, humanhuman

Predictions only

Length 546 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDT1Q9H211 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
CDT1Q9H211 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
CDT1Q9H211 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
CDT1Q9H211 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
CDT1Q9H211 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
CDT1Q9H211 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC29.12■■■□□ 2.25
CDT1Q9H211 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
CDT1Q9H211 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
CDT1Q9H211 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
CDT1Q9H211 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
CDT1Q9H211 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
CDT1Q9H211 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
CDT1Q9H211 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC29.1■■■□□ 2.25
CDT1Q9H211 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
CDT1Q9H211 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
CDT1Q9H211 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC29.1■■■□□ 2.25
CDT1Q9H211 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
CDT1Q9H211 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
CDT1Q9H211 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
CDT1Q9H211 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
CDT1Q9H211 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
CDT1Q9H211 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC29.09■■■□□ 2.25
CDT1Q9H211 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
CDT1Q9H211 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
CDT1Q9H211 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC29.07■■■□□ 2.24
CDT1Q9H211 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CDT1Q9H211 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CDT1Q9H211 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CDT1Q9H211 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
CDT1Q9H211 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CDT1Q9H211 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CDT1Q9H211 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC29.04■■■□□ 2.24
CDT1Q9H211 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CDT1Q9H211 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC29.02■■■□□ 2.24
CDT1Q9H211 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
CDT1Q9H211 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.24
CDT1Q9H211 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
CDT1Q9H211 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
CDT1Q9H211 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
CDT1Q9H211 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
CDT1Q9H211 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
CDT1Q9H211 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
CDT1Q9H211 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CDT1Q9H211 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
CDT1Q9H211 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
CDT1Q9H211 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
CDT1Q9H211 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
CDT1Q9H211 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
CDT1Q9H211 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
CDT1Q9H211 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
CDT1Q9H211 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC28.97■■■□□ 2.23
CDT1Q9H211 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
CDT1Q9H211 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
CDT1Q9H211 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
CDT1Q9H211 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
CDT1Q9H211 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
CDT1Q9H211 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CDT1Q9H211 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC28.94■■■□□ 2.22
CDT1Q9H211 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CDT1Q9H211 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
CDT1Q9H211 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
CDT1Q9H211 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
CDT1Q9H211 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
CDT1Q9H211 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
CDT1Q9H211 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.92■■■□□ 2.22
CDT1Q9H211 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CDT1Q9H211 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CDT1Q9H211 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CDT1Q9H211 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CDT1Q9H211 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC28.9■■■□□ 2.22
CDT1Q9H211 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
CDT1Q9H211 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
CDT1Q9H211 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CDT1Q9H211 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
CDT1Q9H211 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
CDT1Q9H211 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CDT1Q9H211 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CDT1Q9H211 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CDT1Q9H211 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
CDT1Q9H211 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CDT1Q9H211 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
CDT1Q9H211 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
CDT1Q9H211 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
CDT1Q9H211 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
CDT1Q9H211 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CDT1Q9H211 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
CDT1Q9H211 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
CDT1Q9H211 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CDT1Q9H211 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CDT1Q9H211 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
CDT1Q9H211 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
CDT1Q9H211 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CDT1Q9H211 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
CDT1Q9H211 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
CDT1Q9H211 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CDT1Q9H211 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
CDT1Q9H211 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
CDT1Q9H211 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
CDT1Q9H211 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CDT1Q9H211 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.8 ms