Protein–RNA interactions for Protein: Q9H1K6

TLNRD1, Talin rod domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 362 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TLNRD1Q9H1K6 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
TLNRD1Q9H1K6 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TLNRD1Q9H1K6 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TLNRD1Q9H1K6 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TLNRD1Q9H1K6 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TLNRD1Q9H1K6 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TLNRD1Q9H1K6 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TLNRD1Q9H1K6 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TLNRD1Q9H1K6 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TLNRD1Q9H1K6 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TLNRD1Q9H1K6 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TLNRD1Q9H1K6 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TLNRD1Q9H1K6 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TLNRD1Q9H1K6 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TLNRD1Q9H1K6 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TLNRD1Q9H1K6 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TLNRD1Q9H1K6 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TLNRD1Q9H1K6 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TLNRD1Q9H1K6 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TLNRD1Q9H1K6 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TLNRD1Q9H1K6 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TLNRD1Q9H1K6 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TLNRD1Q9H1K6 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TLNRD1Q9H1K6 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TLNRD1Q9H1K6 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TLNRD1Q9H1K6 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TLNRD1Q9H1K6 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TLNRD1Q9H1K6 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TLNRD1Q9H1K6 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TLNRD1Q9H1K6 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TLNRD1Q9H1K6 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TLNRD1Q9H1K6 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TLNRD1Q9H1K6 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TLNRD1Q9H1K6 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TLNRD1Q9H1K6 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TLNRD1Q9H1K6 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TLNRD1Q9H1K6 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TLNRD1Q9H1K6 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TLNRD1Q9H1K6 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TLNRD1Q9H1K6 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TLNRD1Q9H1K6 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TLNRD1Q9H1K6 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TLNRD1Q9H1K6 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TLNRD1Q9H1K6 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TLNRD1Q9H1K6 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
TLNRD1Q9H1K6 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TLNRD1Q9H1K6 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TLNRD1Q9H1K6 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TLNRD1Q9H1K6 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
TLNRD1Q9H1K6 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TLNRD1Q9H1K6 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TLNRD1Q9H1K6 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TLNRD1Q9H1K6 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TLNRD1Q9H1K6 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TLNRD1Q9H1K6 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
TLNRD1Q9H1K6 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TLNRD1Q9H1K6 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
TLNRD1Q9H1K6 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TLNRD1Q9H1K6 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TLNRD1Q9H1K6 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TLNRD1Q9H1K6 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TLNRD1Q9H1K6 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TLNRD1Q9H1K6 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TLNRD1Q9H1K6 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TLNRD1Q9H1K6 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TLNRD1Q9H1K6 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TLNRD1Q9H1K6 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TLNRD1Q9H1K6 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TLNRD1Q9H1K6 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TLNRD1Q9H1K6 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TLNRD1Q9H1K6 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TLNRD1Q9H1K6 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TLNRD1Q9H1K6 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TLNRD1Q9H1K6 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TLNRD1Q9H1K6 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TLNRD1Q9H1K6 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TLNRD1Q9H1K6 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TLNRD1Q9H1K6 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TLNRD1Q9H1K6 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
TLNRD1Q9H1K6 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TLNRD1Q9H1K6 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TLNRD1Q9H1K6 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TLNRD1Q9H1K6 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TLNRD1Q9H1K6 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TLNRD1Q9H1K6 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TLNRD1Q9H1K6 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TLNRD1Q9H1K6 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TLNRD1Q9H1K6 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TLNRD1Q9H1K6 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TLNRD1Q9H1K6 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TLNRD1Q9H1K6 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
TLNRD1Q9H1K6 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
TLNRD1Q9H1K6 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC22.45■■□□□ 1.19
TLNRD1Q9H1K6 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TLNRD1Q9H1K6 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TLNRD1Q9H1K6 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TLNRD1Q9H1K6 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
TLNRD1Q9H1K6 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TLNRD1Q9H1K6 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TLNRD1Q9H1K6 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms