Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZZ0

HOXD1, Homeobox protein Hox-D1, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD1Q9GZZ0 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
HOXD1Q9GZZ0 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
HOXD1Q9GZZ0 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
HOXD1Q9GZZ0 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
HOXD1Q9GZZ0 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
HOXD1Q9GZZ0 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
HOXD1Q9GZZ0 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
HOXD1Q9GZZ0 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
HOXD1Q9GZZ0 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
HOXD1Q9GZZ0 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
HOXD1Q9GZZ0 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
HOXD1Q9GZZ0 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
HOXD1Q9GZZ0 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
HOXD1Q9GZZ0 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
HOXD1Q9GZZ0 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
HOXD1Q9GZZ0 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
HOXD1Q9GZZ0 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
HOXD1Q9GZZ0 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
HOXD1Q9GZZ0 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
HOXD1Q9GZZ0 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
HOXD1Q9GZZ0 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
HOXD1Q9GZZ0 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
HOXD1Q9GZZ0 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
HOXD1Q9GZZ0 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
HOXD1Q9GZZ0 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
HOXD1Q9GZZ0 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
HOXD1Q9GZZ0 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
HOXD1Q9GZZ0 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
HOXD1Q9GZZ0 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
HOXD1Q9GZZ0 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
HOXD1Q9GZZ0 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
HOXD1Q9GZZ0 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
HOXD1Q9GZZ0 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
HOXD1Q9GZZ0 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
HOXD1Q9GZZ0 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
HOXD1Q9GZZ0 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
HOXD1Q9GZZ0 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
HOXD1Q9GZZ0 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
HOXD1Q9GZZ0 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
HOXD1Q9GZZ0 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
HOXD1Q9GZZ0 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
HOXD1Q9GZZ0 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
HOXD1Q9GZZ0 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
HOXD1Q9GZZ0 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
HOXD1Q9GZZ0 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
HOXD1Q9GZZ0 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
HOXD1Q9GZZ0 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
HOXD1Q9GZZ0 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
HOXD1Q9GZZ0 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
HOXD1Q9GZZ0 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
HOXD1Q9GZZ0 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
HOXD1Q9GZZ0 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
HOXD1Q9GZZ0 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
HOXD1Q9GZZ0 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
HOXD1Q9GZZ0 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
HOXD1Q9GZZ0 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
HOXD1Q9GZZ0 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
HOXD1Q9GZZ0 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
HOXD1Q9GZZ0 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
HOXD1Q9GZZ0 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
HOXD1Q9GZZ0 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
HOXD1Q9GZZ0 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
HOXD1Q9GZZ0 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
HOXD1Q9GZZ0 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
HOXD1Q9GZZ0 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
HOXD1Q9GZZ0 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
HOXD1Q9GZZ0 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
HOXD1Q9GZZ0 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
HOXD1Q9GZZ0 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
HOXD1Q9GZZ0 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
HOXD1Q9GZZ0 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
HOXD1Q9GZZ0 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
HOXD1Q9GZZ0 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
HOXD1Q9GZZ0 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
HOXD1Q9GZZ0 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
HOXD1Q9GZZ0 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
HOXD1Q9GZZ0 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
HOXD1Q9GZZ0 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
HOXD1Q9GZZ0 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
HOXD1Q9GZZ0 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
HOXD1Q9GZZ0 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
HOXD1Q9GZZ0 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
HOXD1Q9GZZ0 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
HOXD1Q9GZZ0 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
HOXD1Q9GZZ0 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
HOXD1Q9GZZ0 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
HOXD1Q9GZZ0 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
HOXD1Q9GZZ0 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
HOXD1Q9GZZ0 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
HOXD1Q9GZZ0 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
HOXD1Q9GZZ0 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
HOXD1Q9GZZ0 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
HOXD1Q9GZZ0 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
HOXD1Q9GZZ0 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
HOXD1Q9GZZ0 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
HOXD1Q9GZZ0 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
HOXD1Q9GZZ0 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
HOXD1Q9GZZ0 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
HOXD1Q9GZZ0 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
HOXD1Q9GZZ0 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms