Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0D4

ZNF518B, Zinc finger protein 518B, humanhuman

Predictions only

Length 1,074 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF518BQ9C0D4 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
ZNF518BQ9C0D4 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
ZNF518BQ9C0D4 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
ZNF518BQ9C0D4 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
ZNF518BQ9C0D4 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
ZNF518BQ9C0D4 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
ZNF518BQ9C0D4 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
ZNF518BQ9C0D4 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
ZNF518BQ9C0D4 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
ZNF518BQ9C0D4 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
ZNF518BQ9C0D4 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
ZNF518BQ9C0D4 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
ZNF518BQ9C0D4 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
ZNF518BQ9C0D4 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
ZNF518BQ9C0D4 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
ZNF518BQ9C0D4 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
ZNF518BQ9C0D4 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
ZNF518BQ9C0D4 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
ZNF518BQ9C0D4 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
ZNF518BQ9C0D4 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
ZNF518BQ9C0D4 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
ZNF518BQ9C0D4 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
ZNF518BQ9C0D4 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
ZNF518BQ9C0D4 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
ZNF518BQ9C0D4 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
ZNF518BQ9C0D4 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
ZNF518BQ9C0D4 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
ZNF518BQ9C0D4 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.15
ZNF518BQ9C0D4 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
ZNF518BQ9C0D4 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
ZNF518BQ9C0D4 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
ZNF518BQ9C0D4 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
ZNF518BQ9C0D4 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
ZNF518BQ9C0D4 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
ZNF518BQ9C0D4 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
ZNF518BQ9C0D4 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC28.4■■■□□ 2.14
ZNF518BQ9C0D4 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
ZNF518BQ9C0D4 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
ZNF518BQ9C0D4 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
ZNF518BQ9C0D4 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
ZNF518BQ9C0D4 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
ZNF518BQ9C0D4 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
ZNF518BQ9C0D4 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
ZNF518BQ9C0D4 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
ZNF518BQ9C0D4 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
ZNF518BQ9C0D4 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
ZNF518BQ9C0D4 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
ZNF518BQ9C0D4 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
ZNF518BQ9C0D4 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
ZNF518BQ9C0D4 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
ZNF518BQ9C0D4 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC28.35■■■□□ 2.13
ZNF518BQ9C0D4 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
ZNF518BQ9C0D4 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
ZNF518BQ9C0D4 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC28.34■■■□□ 2.13
ZNF518BQ9C0D4 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
ZNF518BQ9C0D4 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
ZNF518BQ9C0D4 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
ZNF518BQ9C0D4 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
ZNF518BQ9C0D4 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
ZNF518BQ9C0D4 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
ZNF518BQ9C0D4 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
ZNF518BQ9C0D4 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
ZNF518BQ9C0D4 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
ZNF518BQ9C0D4 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
ZNF518BQ9C0D4 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
ZNF518BQ9C0D4 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
ZNF518BQ9C0D4 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
ZNF518BQ9C0D4 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
ZNF518BQ9C0D4 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
ZNF518BQ9C0D4 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
ZNF518BQ9C0D4 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
ZNF518BQ9C0D4 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
ZNF518BQ9C0D4 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
ZNF518BQ9C0D4 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC28.25■■■□□ 2.11
ZNF518BQ9C0D4 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
ZNF518BQ9C0D4 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
ZNF518BQ9C0D4 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
ZNF518BQ9C0D4 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
ZNF518BQ9C0D4 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
ZNF518BQ9C0D4 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
ZNF518BQ9C0D4 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
ZNF518BQ9C0D4 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
ZNF518BQ9C0D4 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
ZNF518BQ9C0D4 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
ZNF518BQ9C0D4 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
ZNF518BQ9C0D4 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
ZNF518BQ9C0D4 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
ZNF518BQ9C0D4 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
ZNF518BQ9C0D4 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
ZNF518BQ9C0D4 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
ZNF518BQ9C0D4 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
ZNF518BQ9C0D4 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
ZNF518BQ9C0D4 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC28.18■■■□□ 2.1
ZNF518BQ9C0D4 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
ZNF518BQ9C0D4 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
ZNF518BQ9C0D4 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
ZNF518BQ9C0D4 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
ZNF518BQ9C0D4 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
ZNF518BQ9C0D4 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
ZNF518BQ9C0D4 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms