Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZC7

ABCA2, ATP-binding cassette sub-family A member 2, humanhuman

Predictions only

Length 2,435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCA2Q9BZC7 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ABCA2Q9BZC7 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ABCA2Q9BZC7 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ABCA2Q9BZC7 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ABCA2Q9BZC7 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ABCA2Q9BZC7 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
ABCA2Q9BZC7 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ABCA2Q9BZC7 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ABCA2Q9BZC7 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ABCA2Q9BZC7 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ABCA2Q9BZC7 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ABCA2Q9BZC7 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ABCA2Q9BZC7 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ABCA2Q9BZC7 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ABCA2Q9BZC7 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ABCA2Q9BZC7 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ABCA2Q9BZC7 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ABCA2Q9BZC7 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
ABCA2Q9BZC7 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ABCA2Q9BZC7 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
ABCA2Q9BZC7 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ABCA2Q9BZC7 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ABCA2Q9BZC7 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
ABCA2Q9BZC7 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ABCA2Q9BZC7 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ABCA2Q9BZC7 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ABCA2Q9BZC7 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ABCA2Q9BZC7 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ABCA2Q9BZC7 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ABCA2Q9BZC7 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ABCA2Q9BZC7 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ABCA2Q9BZC7 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ABCA2Q9BZC7 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ABCA2Q9BZC7 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ABCA2Q9BZC7 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ABCA2Q9BZC7 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ABCA2Q9BZC7 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ABCA2Q9BZC7 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ABCA2Q9BZC7 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ABCA2Q9BZC7 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ABCA2Q9BZC7 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
ABCA2Q9BZC7 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ABCA2Q9BZC7 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ABCA2Q9BZC7 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ABCA2Q9BZC7 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ABCA2Q9BZC7 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
ABCA2Q9BZC7 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ABCA2Q9BZC7 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ABCA2Q9BZC7 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ABCA2Q9BZC7 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ABCA2Q9BZC7 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ABCA2Q9BZC7 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ABCA2Q9BZC7 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ABCA2Q9BZC7 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ABCA2Q9BZC7 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
ABCA2Q9BZC7 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ABCA2Q9BZC7 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ABCA2Q9BZC7 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ABCA2Q9BZC7 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ABCA2Q9BZC7 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ABCA2Q9BZC7 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ABCA2Q9BZC7 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ABCA2Q9BZC7 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ABCA2Q9BZC7 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ABCA2Q9BZC7 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ABCA2Q9BZC7 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ABCA2Q9BZC7 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ABCA2Q9BZC7 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ABCA2Q9BZC7 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ABCA2Q9BZC7 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ABCA2Q9BZC7 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ABCA2Q9BZC7 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ABCA2Q9BZC7 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ABCA2Q9BZC7 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ABCA2Q9BZC7 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ABCA2Q9BZC7 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ABCA2Q9BZC7 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ABCA2Q9BZC7 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ABCA2Q9BZC7 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ABCA2Q9BZC7 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ABCA2Q9BZC7 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ABCA2Q9BZC7 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ABCA2Q9BZC7 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ABCA2Q9BZC7 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ABCA2Q9BZC7 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ABCA2Q9BZC7 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ABCA2Q9BZC7 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ABCA2Q9BZC7 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ABCA2Q9BZC7 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ABCA2Q9BZC7 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ABCA2Q9BZC7 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ABCA2Q9BZC7 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ABCA2Q9BZC7 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ABCA2Q9BZC7 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ABCA2Q9BZC7 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ABCA2Q9BZC7 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ABCA2Q9BZC7 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ABCA2Q9BZC7 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ABCA2Q9BZC7 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ABCA2Q9BZC7 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.5 ms