Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXL8

CDCA4, Cell division cycle-associated protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDCA4Q9BXL8 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CDCA4Q9BXL8 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CDCA4Q9BXL8 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CDCA4Q9BXL8 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CDCA4Q9BXL8 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CDCA4Q9BXL8 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CDCA4Q9BXL8 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CDCA4Q9BXL8 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CDCA4Q9BXL8 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CDCA4Q9BXL8 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CDCA4Q9BXL8 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CDCA4Q9BXL8 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CDCA4Q9BXL8 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CDCA4Q9BXL8 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CDCA4Q9BXL8 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CDCA4Q9BXL8 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CDCA4Q9BXL8 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CDCA4Q9BXL8 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CDCA4Q9BXL8 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CDCA4Q9BXL8 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CDCA4Q9BXL8 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CDCA4Q9BXL8 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CDCA4Q9BXL8 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CDCA4Q9BXL8 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CDCA4Q9BXL8 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
CDCA4Q9BXL8 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CDCA4Q9BXL8 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CDCA4Q9BXL8 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CDCA4Q9BXL8 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CDCA4Q9BXL8 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CDCA4Q9BXL8 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CDCA4Q9BXL8 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CDCA4Q9BXL8 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CDCA4Q9BXL8 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CDCA4Q9BXL8 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CDCA4Q9BXL8 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CDCA4Q9BXL8 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CDCA4Q9BXL8 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CDCA4Q9BXL8 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CDCA4Q9BXL8 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CDCA4Q9BXL8 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CDCA4Q9BXL8 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CDCA4Q9BXL8 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CDCA4Q9BXL8 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CDCA4Q9BXL8 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CDCA4Q9BXL8 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CDCA4Q9BXL8 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CDCA4Q9BXL8 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CDCA4Q9BXL8 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CDCA4Q9BXL8 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CDCA4Q9BXL8 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CDCA4Q9BXL8 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CDCA4Q9BXL8 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CDCA4Q9BXL8 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CDCA4Q9BXL8 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CDCA4Q9BXL8 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CDCA4Q9BXL8 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CDCA4Q9BXL8 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
CDCA4Q9BXL8 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CDCA4Q9BXL8 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CDCA4Q9BXL8 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CDCA4Q9BXL8 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
CDCA4Q9BXL8 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CDCA4Q9BXL8 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CDCA4Q9BXL8 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CDCA4Q9BXL8 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
CDCA4Q9BXL8 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CDCA4Q9BXL8 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CDCA4Q9BXL8 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CDCA4Q9BXL8 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CDCA4Q9BXL8 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CDCA4Q9BXL8 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CDCA4Q9BXL8 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CDCA4Q9BXL8 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CDCA4Q9BXL8 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CDCA4Q9BXL8 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CDCA4Q9BXL8 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CDCA4Q9BXL8 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CDCA4Q9BXL8 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CDCA4Q9BXL8 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CDCA4Q9BXL8 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CDCA4Q9BXL8 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CDCA4Q9BXL8 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CDCA4Q9BXL8 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CDCA4Q9BXL8 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CDCA4Q9BXL8 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CDCA4Q9BXL8 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CDCA4Q9BXL8 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CDCA4Q9BXL8 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CDCA4Q9BXL8 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CDCA4Q9BXL8 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CDCA4Q9BXL8 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CDCA4Q9BXL8 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CDCA4Q9BXL8 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CDCA4Q9BXL8 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CDCA4Q9BXL8 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CDCA4Q9BXL8 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CDCA4Q9BXL8 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CDCA4Q9BXL8 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CDCA4Q9BXL8 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 105.7 ms