Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWW4

SSBP3, Single-stranded DNA-binding protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSBP3Q9BWW4 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SSBP3Q9BWW4 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SSBP3Q9BWW4 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SSBP3Q9BWW4 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SSBP3Q9BWW4 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SSBP3Q9BWW4 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SSBP3Q9BWW4 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SSBP3Q9BWW4 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SSBP3Q9BWW4 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SSBP3Q9BWW4 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SSBP3Q9BWW4 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SSBP3Q9BWW4 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SSBP3Q9BWW4 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SSBP3Q9BWW4 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SSBP3Q9BWW4 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SSBP3Q9BWW4 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SSBP3Q9BWW4 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SSBP3Q9BWW4 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SSBP3Q9BWW4 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SSBP3Q9BWW4 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SSBP3Q9BWW4 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SSBP3Q9BWW4 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SSBP3Q9BWW4 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SSBP3Q9BWW4 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SSBP3Q9BWW4 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SSBP3Q9BWW4 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SSBP3Q9BWW4 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SSBP3Q9BWW4 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SSBP3Q9BWW4 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SSBP3Q9BWW4 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SSBP3Q9BWW4 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SSBP3Q9BWW4 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SSBP3Q9BWW4 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SSBP3Q9BWW4 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SSBP3Q9BWW4 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SSBP3Q9BWW4 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
SSBP3Q9BWW4 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SSBP3Q9BWW4 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SSBP3Q9BWW4 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SSBP3Q9BWW4 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SSBP3Q9BWW4 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SSBP3Q9BWW4 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SSBP3Q9BWW4 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SSBP3Q9BWW4 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SSBP3Q9BWW4 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SSBP3Q9BWW4 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SSBP3Q9BWW4 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SSBP3Q9BWW4 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SSBP3Q9BWW4 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SSBP3Q9BWW4 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SSBP3Q9BWW4 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SSBP3Q9BWW4 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SSBP3Q9BWW4 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SSBP3Q9BWW4 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SSBP3Q9BWW4 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SSBP3Q9BWW4 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SSBP3Q9BWW4 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SSBP3Q9BWW4 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SSBP3Q9BWW4 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
SSBP3Q9BWW4 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
SSBP3Q9BWW4 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
SSBP3Q9BWW4 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SSBP3Q9BWW4 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SSBP3Q9BWW4 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SSBP3Q9BWW4 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SSBP3Q9BWW4 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SSBP3Q9BWW4 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SSBP3Q9BWW4 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SSBP3Q9BWW4 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SSBP3Q9BWW4 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SSBP3Q9BWW4 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SSBP3Q9BWW4 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SSBP3Q9BWW4 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SSBP3Q9BWW4 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SSBP3Q9BWW4 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SSBP3Q9BWW4 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SSBP3Q9BWW4 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
SSBP3Q9BWW4 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SSBP3Q9BWW4 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SSBP3Q9BWW4 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SSBP3Q9BWW4 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SSBP3Q9BWW4 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SSBP3Q9BWW4 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SSBP3Q9BWW4 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SSBP3Q9BWW4 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SSBP3Q9BWW4 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SSBP3Q9BWW4 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SSBP3Q9BWW4 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SSBP3Q9BWW4 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SSBP3Q9BWW4 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SSBP3Q9BWW4 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SSBP3Q9BWW4 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SSBP3Q9BWW4 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
SSBP3Q9BWW4 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SSBP3Q9BWW4 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
SSBP3Q9BWW4 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SSBP3Q9BWW4 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SSBP3Q9BWW4 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SSBP3Q9BWW4 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SSBP3Q9BWW4 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.5 ms