Protein–RNA interactions for Protein: Q9BT67

NDFIP1, NEDD4 family-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDFIP1Q9BT67 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NDFIP1Q9BT67 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NDFIP1Q9BT67 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NDFIP1Q9BT67 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NDFIP1Q9BT67 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NDFIP1Q9BT67 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NDFIP1Q9BT67 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NDFIP1Q9BT67 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NDFIP1Q9BT67 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NDFIP1Q9BT67 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NDFIP1Q9BT67 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NDFIP1Q9BT67 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NDFIP1Q9BT67 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NDFIP1Q9BT67 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NDFIP1Q9BT67 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
NDFIP1Q9BT67 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NDFIP1Q9BT67 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
NDFIP1Q9BT67 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NDFIP1Q9BT67 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NDFIP1Q9BT67 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NDFIP1Q9BT67 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NDFIP1Q9BT67 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NDFIP1Q9BT67 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NDFIP1Q9BT67 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NDFIP1Q9BT67 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NDFIP1Q9BT67 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NDFIP1Q9BT67 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NDFIP1Q9BT67 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NDFIP1Q9BT67 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NDFIP1Q9BT67 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NDFIP1Q9BT67 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NDFIP1Q9BT67 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NDFIP1Q9BT67 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NDFIP1Q9BT67 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NDFIP1Q9BT67 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NDFIP1Q9BT67 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
NDFIP1Q9BT67 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
NDFIP1Q9BT67 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NDFIP1Q9BT67 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
NDFIP1Q9BT67 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
NDFIP1Q9BT67 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
NDFIP1Q9BT67 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NDFIP1Q9BT67 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NDFIP1Q9BT67 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
NDFIP1Q9BT67 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
NDFIP1Q9BT67 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
NDFIP1Q9BT67 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
NDFIP1Q9BT67 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
NDFIP1Q9BT67 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
NDFIP1Q9BT67 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
NDFIP1Q9BT67 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
NDFIP1Q9BT67 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
NDFIP1Q9BT67 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
NDFIP1Q9BT67 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
NDFIP1Q9BT67 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
NDFIP1Q9BT67 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
NDFIP1Q9BT67 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
NDFIP1Q9BT67 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
NDFIP1Q9BT67 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
NDFIP1Q9BT67 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
NDFIP1Q9BT67 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
NDFIP1Q9BT67 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
NDFIP1Q9BT67 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
NDFIP1Q9BT67 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
NDFIP1Q9BT67 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
NDFIP1Q9BT67 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
NDFIP1Q9BT67 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
NDFIP1Q9BT67 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
NDFIP1Q9BT67 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
NDFIP1Q9BT67 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
NDFIP1Q9BT67 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
NDFIP1Q9BT67 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
NDFIP1Q9BT67 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
NDFIP1Q9BT67 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
NDFIP1Q9BT67 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
NDFIP1Q9BT67 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
NDFIP1Q9BT67 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
NDFIP1Q9BT67 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
NDFIP1Q9BT67 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
NDFIP1Q9BT67 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
NDFIP1Q9BT67 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
NDFIP1Q9BT67 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
NDFIP1Q9BT67 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
NDFIP1Q9BT67 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
NDFIP1Q9BT67 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
NDFIP1Q9BT67 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
NDFIP1Q9BT67 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
NDFIP1Q9BT67 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
NDFIP1Q9BT67 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
NDFIP1Q9BT67 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
NDFIP1Q9BT67 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
NDFIP1Q9BT67 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
NDFIP1Q9BT67 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
NDFIP1Q9BT67 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
NDFIP1Q9BT67 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
NDFIP1Q9BT67 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
NDFIP1Q9BT67 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
NDFIP1Q9BT67 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
NDFIP1Q9BT67 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
NDFIP1Q9BT67 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 7.7 ms