Protein–RNA interactions for Protein: Q9BS16

CENPK, Centromere protein K, humanhuman

Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPKQ9BS16 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
CENPKQ9BS16 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CENPKQ9BS16 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CENPKQ9BS16 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CENPKQ9BS16 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CENPKQ9BS16 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
CENPKQ9BS16 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CENPKQ9BS16 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CENPKQ9BS16 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CENPKQ9BS16 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CENPKQ9BS16 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CENPKQ9BS16 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CENPKQ9BS16 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CENPKQ9BS16 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CENPKQ9BS16 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CENPKQ9BS16 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CENPKQ9BS16 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CENPKQ9BS16 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CENPKQ9BS16 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CENPKQ9BS16 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CENPKQ9BS16 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CENPKQ9BS16 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CENPKQ9BS16 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CENPKQ9BS16 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CENPKQ9BS16 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
CENPKQ9BS16 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CENPKQ9BS16 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CENPKQ9BS16 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CENPKQ9BS16 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CENPKQ9BS16 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CENPKQ9BS16 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CENPKQ9BS16 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CENPKQ9BS16 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CENPKQ9BS16 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CENPKQ9BS16 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CENPKQ9BS16 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CENPKQ9BS16 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CENPKQ9BS16 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CENPKQ9BS16 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
CENPKQ9BS16 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CENPKQ9BS16 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CENPKQ9BS16 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CENPKQ9BS16 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CENPKQ9BS16 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CENPKQ9BS16 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CENPKQ9BS16 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CENPKQ9BS16 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CENPKQ9BS16 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CENPKQ9BS16 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CENPKQ9BS16 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CENPKQ9BS16 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CENPKQ9BS16 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CENPKQ9BS16 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CENPKQ9BS16 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CENPKQ9BS16 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CENPKQ9BS16 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
CENPKQ9BS16 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CENPKQ9BS16 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CENPKQ9BS16 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CENPKQ9BS16 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
CENPKQ9BS16 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CENPKQ9BS16 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
CENPKQ9BS16 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CENPKQ9BS16 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CENPKQ9BS16 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CENPKQ9BS16 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CENPKQ9BS16 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CENPKQ9BS16 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CENPKQ9BS16 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CENPKQ9BS16 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CENPKQ9BS16 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CENPKQ9BS16 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CENPKQ9BS16 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CENPKQ9BS16 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CENPKQ9BS16 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CENPKQ9BS16 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CENPKQ9BS16 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CENPKQ9BS16 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CENPKQ9BS16 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CENPKQ9BS16 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CENPKQ9BS16 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CENPKQ9BS16 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CENPKQ9BS16 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CENPKQ9BS16 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CENPKQ9BS16 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CENPKQ9BS16 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
CENPKQ9BS16 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CENPKQ9BS16 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CENPKQ9BS16 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CENPKQ9BS16 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CENPKQ9BS16 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CENPKQ9BS16 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CENPKQ9BS16 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CENPKQ9BS16 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CENPKQ9BS16 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CENPKQ9BS16 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CENPKQ9BS16 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CENPKQ9BS16 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CENPKQ9BS16 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CENPKQ9BS16 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.9 ms